RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		H3BSA7	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TNFSF11	O14788	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PHYH	O14832	338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	EFNA2	O43921	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SLC16A7	O60669	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SEC14L2	O76054	403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	INMT	O95050	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	IGHG1	P01857	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	MT-ND5	P03915	603 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	HTR1A	P08908	422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TACSTD2	P09758	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF823	P16415	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CD36	P16671	472 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF24	P17028	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PCMT1	P22061	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FPR2	P25090	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RFC3	P40938	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	MAGEA5	P43359	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ID4	P47928	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TMBIM6	P55061	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	BID	P55957	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	WNT4	P56705	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	HSF2	Q03933	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	GLO1	Q04760	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FHL1	Q13642	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	THEM4	Q5T1C6	240 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	XAF1	Q6GPH4	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FAM122B	Q7Z309	247 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR2T27	Q8NH04	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SGCD	Q92629	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	NTNG2	Q96CW9	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	COG8	Q96MW5	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	MGLL	Q99685	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	NPAS1	Q99742	590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		A0A0J9YW62	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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