RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528252.5

SOX6-210, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SOX6, Length 2,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-210ENST00000528252 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SPSB2Q99619 263 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 ADAM19Q9H013 955 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 OR51J1Q9H342 316 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 DLL4Q9NR61 685 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 A0A1W2PQD3 144 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 VSTM2BA6NLU5 285 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 M0R296 226 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 FADS1O60427 444 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SNAPINO95295 136 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SBK2P0C263 348 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 CCL4P13236 92 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 ZNF28P17035 718 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SLC2A5P22732 501 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SLC6A1P30531 599 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SLC6A8P48029 635 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 NRG3P56975 720 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 LTBQ06643 244 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 PLA1AQ53H76 456 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 VASNQ6EMK4 673 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 OR5M10Q6IEU7 315 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SLC43A2Q8N370 569 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 HGDQ93099 445 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 RELTQ969Z4 430 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 RASD2Q96D21 266 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SCMH1Q96GD3 660 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 NMNAT3Q96T66 252 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 LPAR4Q99677 370 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 TIMP4Q99727 224 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SOSTQ9BQB4 213 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 ALG8Q9BVK2 526 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 MMP25Q9NPA2 562 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.45□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 C7orf66A4D0T2 115 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 C2orf72A6NCS6 295 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 NCR1O76036 304 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SIX6O95475 246 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 IL1AP01583 271 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 ADRB1P08588 477 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 PGCP20142 388 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 CXCR1P25024 350 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 FBXW4P57775 412 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 PRPS1P60891 318 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 FABP5Q01469 135 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 FGL1Q08830 312 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 ZNF124Q15973 351 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 OR5W2Q8NH69 310 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 TAAR8Q969N4 342 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 Q96M85 177 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 TMED9Q9BVK6 235 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 JAM3Q9BX67 310 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 CACNA1HO95180 2353 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 GPR171O14626 319 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 ARPC3O15145 178 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 DHFRP00374 187 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 RLN2P04090 185 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 F13BP05160 661 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 FGF5P12034 268 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 GP1BBP13224 206 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 PTAFRP25105 342 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 GABRA5P31644 462 aa7.44□□□□□ -1.22
SOX6-210ENST00000528252 EIF1P41567 113 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms