RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, human

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1B-208	ENST00000515588	INHBB	P09529	407 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ITGA2	P17301	1181 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	CDA	P32320	146 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SERPINF1	P36955	418 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ERVK-25	P63136	954 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	MS4A2	Q01362	244 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	TNK1	Q13470	666 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	RAB39A	Q14964	217 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ZBED5	Q49AG3	693 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	CDK20	Q8IZL9	346 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	NUP37	Q8NFH4	326 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	NSMAF	Q92636	917 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ALG12	Q9BV10	488 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	RTTN	Q86VV8	2226 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588		H7C417	338 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	PDE5A	O76074	875 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	RAB36	O95755	333 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	CD14	P08571	375 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	OR4A8	P0C604	315 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF35	P13682	527 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	THBS4	P35443	961 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	FXYD6P3	P58550	94 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SPIB	Q01892	262 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	CD47	Q08722	323 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	BDH2	Q9BUT1	245 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588		H7C1C5	153 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	GADD45G	O95257	159 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SERPINA5	P05154	406 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	FABP3	P05413	133 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	NR4A1	P22736	598 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF84	P51523	738 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	LCN6	P62502	163 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ETFDH	Q16134	617 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	MSMP	Q1L6U9	139 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	MEST	Q5EB52	335 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	KRT80	Q6KB66	452 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	FAM122B	Q7Z309	247 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	BIVM	Q86UB2	503 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588		Q96M85	177 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	TMEM129	A0AVI4	362 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588		A6NIZ1	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SSX4	O60224	188 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	RRM2	P31350	389 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SMIM11A	P58511	58 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	RAP1B	P61224	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	RAP1A	P62834	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	CHRNB3	Q05901	458 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	DAG1	Q14118	895 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	EFNB3	Q15768	340 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	THEM4	Q5T1C6	240 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	LCN8	Q6JVE9	175 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	C1orf21	Q9H246	121 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	PLK3	Q9H4B4	646 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERF1B-208	ENST00000515588	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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