RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	LRRC18	Q8N456	261 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	ASB10	Q8WXI3	467 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	MAGEB18	Q96M61	343 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	SEPHS2	Q99611	448 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	NANOG	Q9H9S0	305 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	CDH20	Q9HBT6	801 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	NPHS2	Q9NP85	383 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	METRN	Q9UJH8	293 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110		A0A1W2PRG6	482 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	C17orf100	A8MU93	164 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	OR7A10	O76100	309 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	VENTX	O95231	258 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	MT-ND1	P03886	318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	ACADS	P16219	412 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	FUT1	P19526	365 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	AQP2	P41181	271 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF84	P51523	738 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	UCP2	P55851	309 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	SELENOV	P59797	346 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	NRN1L	Q496H8	165 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	RABL3	Q5HYI8	236 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	AVPI1	Q5T686	147 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF519	Q8TB69	540 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	C1orf198	Q9H425	327 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	OCEL1	Q9H607	264 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110		A0A0G2JND7	137 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	CENPBD1	B2RD01	187 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC2A10	O95528	541 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	PTH	P01270	115 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	TSPAN19	P0C672	248 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	CDA	P32320	146 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	RAD52	P43351	418 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	OR1E2	P47887	323 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	TAS2R41	P59536	307 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	MVK	Q03426	396 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	GLO1	Q04760	184 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	PLP2	Q04941	152 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	C10orf128	Q5T292	105 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	DEF8	Q6ZN54	512 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	SNX33	Q8WV41	574 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM239	Q8WW34	195 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	NABP1	Q96AH0	204 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	SGTB	Q96EQ0	304 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	INIP	Q9NRY2	104 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	FXYD1	O00168	92 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	MGRN1	O60291	552 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SNHG4-208	ENST00000514110	PIP5K1C	O60331	668 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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