RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 SSX8Q7RTT4 187 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 MDP1Q86V88 176 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 SKA3Q8IX90 412 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 LINC00471Q8N535 108 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 GIPC3Q8TF64 312 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 YY1AP1Q9H869 796 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 NTN4Q9HB63 628 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 CACNA1DQ01668 2161 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 PRSS37A4D1T9 235 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 SHISA9B4DS77 424 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 XKRYO14609 159 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 ARPC3O15145 178 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 E2F6O75461 281 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 SOX14O95416 240 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 TXNDC12O95881 172 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 IGKV3-15P01624 115 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 IGLV1-44P01699 117 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 CECR9P0C854 216 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 CD79AP11912 226 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 CBR1P16152 277 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 PRKACGP22612 351 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 PTAFRP25105 342 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 ZNF84P51523 738 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 RPS6KA3P51812 740 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 NPRL3Q12980 569 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 GK3PQ14409 553 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 THEM4Q5T1C6 240 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.53□□□□□ -1.2
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PKP4-216ENST00000495123 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.53□□□□□ -1.2
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PKP4-216ENST00000495123 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 NABP1Q96AH0 204 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 ITPKCQ96DU7 683 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 ZNF75AQ96N20 296 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 RBP7Q96R05 134 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 FEVQ99581 238 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 SH3GL3Q99963 347 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 IFT27Q9BW83 186 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 SYT4Q9H2B2 425 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 B3GNT2Q9NY97 397 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 IL20Q9NYY1 176 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.53□□□□□ -1.2
PKP4-216ENST00000495123 AP4S1Q9Y587 144 aa7.53□□□□□ -1.2
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PKP4-216ENST00000495123 A0A1W2PPL8 197 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.52□□□□□ -1.21
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PKP4-216ENST00000495123 HS3ST1O14792 307 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 LILRA1O75019 489 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 ATE1O95260 518 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 SCG5P05408 212 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 NR2C1P13056 603 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 CTLA4P16410 223 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 CD53P19397 219 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 GSTM3P21266 225 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 CALCRP30988 508 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 GIPRP48546 466 aa7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PKP4-216ENST00000495123 ACTR3P61158 418 aa7.52□□□□□ -1.21
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