RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483268.1

RHBDD1-212, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-212ENST00000483268 CCDC134Q9H6E4 229 aa5.06□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.06□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 NGBQ9NPG2 151 aa5.06□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 AIG1Q9NVV5 245 aa5.06□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 THAP1Q9NVV9 213 aa5.06□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 LIPT1Q9Y234 373 aa5.06□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa5.06□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 RNF115Q9Y4L5 304 aa5.06□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 DNHD1Q96M86 4753 aa5.06□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 GOLGA8OA6NCC3 632 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 OR5H1A6NKK0 313 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 SHISA9B4DS77 424 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 MCIDASD6RGH6 385 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 E9PBE3 544 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 GOLGA8NF8WBI6 632 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 PDLIM1O00151 329 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 AP3D1O14617 1153 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 HDAC3O15379 428 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 CLOCKO15516 846 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 ZNF208O43345 1280 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 NDUFS7O75251 213 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 PMS2P2O95744 297 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 IGHV3-9P01782 118 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 CHRM4P08173 479 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 CCNA2P20248 432 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 GRK5P34947 590 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 SLC1A3P43003 542 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 MVDP53602 400 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 ATP5J2P56134 94 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 EGR4Q05215 589 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 BSPH1Q075Z2 132 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 PPA1Q15181 289 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 GABRA6Q16445 453 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 GSTA3Q16772 222 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 GPAT3Q53EU6 434 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 TIMM23BQ5SRD1 257 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 HHATQ5VTY9 493 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 C3orf33Q6P1S2 294 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 DNM1P46Q6ZS02 220 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 GRINAQ7Z429 371 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 ZNF100Q8IYN0 542 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 KIRREL3Q8IZU9 778 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 ZIC4Q8N9L1 334 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 ZNF563Q8TA94 476 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 PANX1Q96RD7 426 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 SLC6A13Q9NSD5 602 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 TMEM181Q9P2C4 612 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 CHRNA9Q9UGM1 479 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 OSGIN1Q9UJX0 560 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 PRDM4Q9UKN5 801 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa5.05□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 TMEM120BA0PK00 339 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 TMEM72A0PK05 275 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 TRPC5OSA6NMA1 111 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 E7EQL1 145 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 SLCO1B7G3V0H7 640 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 FAAHO00519 579 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 GPR171O14626 319 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 DNPH1O43598 174 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 SLC22A3O75751 556 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 IL6P05231 212 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 ZCCHC18P0CG32 403 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 NR2F1P10589 423 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 IL7RP16871 459 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 GGT1P19440 569 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 COX5AP20674 150 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 PTNP21246 168 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 MAGEA8P43361 318 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 HTR3AP46098 478 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 KHKP50053 298 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 OR2B6P58173 313 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 SLC35A1P78382 337 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 LRRC74AQ0VAA2 488 aa5.04□□□□□ -1.6
RHBDD1-212ENST00000483268 EPS8Q12929 822 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms