RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 ERVK-25P63136 954 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 SKA3Q8IX90 412 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 MUC15Q8N387 334 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 WFDC11Q8NEX6 87 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 FNDC8Q8TC99 324 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 HTRA1Q92743 480 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 ZNF570Q96NI8 536 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 UNC119BA6NIH7 251 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 KRT36O76013 467 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 CD14P08571 375 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 PAX1P15863 534 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 CALCRP30988 508 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 IFNGR2P38484 337 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 CDKN1AP38936 164 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 GIPRP48546 466 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 RAB1AP62820 205 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 CHRNB3Q05901 458 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 NRN1LQ496H8 165 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 CLDN22Q8N7P3 220 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 FANK1Q8TC84 345 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 SH3GL3Q99963 347 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 BTBD10Q9BSF8 475 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 OVOL3O00110 214 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 XKRYO14609 159 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 ATP5J2P56134 94 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 THEM4Q5T1C6 240 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 ZER1Q7Z7L7 766 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 NSMAFQ92636 917 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 Q96M85 177 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 RBP7Q96R05 134 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 GRIP2Q9C0E4 1043 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 CBLN4Q9NTU7 201 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 IL20RAQ9UHF4 553 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 FBXL3Q9UKT7 428 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 ACOT8O14734 319 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 PTP4A3O75365 173 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 CD8AP01732 235 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 FPR3P25089 353 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 SLC36A2Q495M3 483 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 MESTQ5EB52 335 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 SMARCD3Q6STE5 483 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 THSD4Q6ZMP0 1018 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 SLC16A14Q7RTX9 510 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 FAM122BQ7Z309 247 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 DPPA2Q7Z7J5 298 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 IL17RDQ8NFM7 739 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 OR4F15Q8NGB8 312 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 MS4A3Q96HJ5 214 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 GPA33Q99795 319 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 CA10Q9NS85 328 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 H7C1C5 153 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 TNFRSF11BO00300 401 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 PATE4P0C8F1 98 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 SDHAP31040 664 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 FXYD6P3P58550 94 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 LCN6P62502 163 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 C11orf71Q6IPW1 123 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 PRSS57Q6UWY2 283 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 LRRC18Q8N456 261 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 ZNF75AQ96N20 296 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 RNF121Q9H920 327 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 NRIP3Q9NQ35 241 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 ACANP16112 2415 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 RAP2AP10114 183 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 CD99P14209 185 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 NPR2P20594 1047 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 CDAP32320 146 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 BNIP1Q12981 228 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 FLOT2Q14254 428 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 GPR139Q6DWJ6 353 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 TMEM53Q6P2H8 277 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 VHLLQ6RSH7 139 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 LINC00471Q8N535 108 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 NUP37Q8NFH4 326 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-208ENST00000481121 FGFBP3Q8TAT2 258 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms