RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 CDC20BQ86Y33 519 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PM20D2Q8IYS1 436 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 OR5M1Q8NGP8 315 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 OR6K6Q8NGW6 343 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SNX33Q8WV41 574 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 DACH2Q96NX9 599 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 NUAK2Q9H093 628 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SYT4Q9H2B2 425 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PINLYPA6NC86 204 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 OGG1O15527 345 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SLC16A7O60669 478 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TMCC2O75069 709 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 AQP8O94778 261 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 APOL3O95236 402 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TFP02787 698 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PRKAR1AP10644 381 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 HLA-DOBP13765 273 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 ALOX5APP20292 161 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SHC1P29353 583 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PYCR1P32322 319 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 CRYBB2P43320 205 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 CD97P48960 835 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TGM4P49221 684 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 MEOX1P50221 254 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 CCL11P51671 97 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 BIDP55957 195 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 GPR85P60893 370 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 FOXK1P85037 733 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SLC17A1Q14916 467 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SLC10A1Q14973 349 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 HIST3H3Q16695 136 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PCK2Q16822 640 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 C4orf17Q53FE4 359 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 HBMQ6B0K9 141 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 DEGS2Q6QHC5 323 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PAMR1Q6UXH9 720 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 GGNQ86UU5 652 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 MEIOBQ8N635 442 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 ZPLD1Q8TCW7 415 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PHYHIPQ92561 330 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TIMP4Q99727 224 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 MED18Q9BUE0 208 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 RNF122Q9H9V4 155 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 LAMP5Q9UJQ1 280 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 RCE1Q9Y256 329 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 MPDZO75970 2070 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PPW3 197 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 METTL15A6NJ78 407 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 A6NL46 340 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 NPIPA2E9PIF3 369 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 DCTN6O00399 190 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 GPR171O14626 319 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 TNFSF11O14788 317 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 EFSO43281 561 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 GPRIN2O60269 458 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF254O75437 659 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SERPINI2O75830 405 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 SERPINA3P01011 423 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PGA4P0DJD7 388 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PGA3P0DJD8 388 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 PCSK6P29122 969 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1A-202ENST00000409024 ENTPD1P49961 510 aa8.73□□□□□ -1.01
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