RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 IGHG1P01857 330 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ZNF823P16415 610 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ZNF43P17038 809 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 SHC1P29353 583 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 SFTPDP35247 375 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 DNASE1L1P49184 302 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 BIDP55957 195 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 LIPNQ5VXI9 398 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 THRSPQ92748 146 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 TXNDC15Q96J42 360 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 OR8B4Q96RC9 309 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 CCDC32Q9BV29 185 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 IL17BQ9UHF5 180 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.53□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 PRR32B1ATL7 298 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 TMCC2O75069 709 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 UPK1BO75841 260 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 UCHL1P09936 223 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 CD96P40200 585 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 CCR9P51686 369 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 SOX8P57073 446 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 GPR85P60893 370 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 PPP3R1P63098 170 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 HBMQ6B0K9 141 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ZNF544Q6NX49 715 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 Q6ZNX1 250 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 THEM6Q8WUY1 208 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 MROQ9BYG7 248 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 MED29Q9NX70 200 aa14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
HPS1-202ENST00000338546 ALPK2Q86TB3 2170 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 SHISA3A0PJX4 238 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 ZNF879B4DU55 563 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 G3V3Y1 287 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 RGS5O15539 181 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 ZNF254O75437 659 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 CEACAM1P13688 526 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 ITGA3P26006 1051 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 ADAM8P78325 824 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 C19orf57Q0VDD7 668 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 SLC17A1Q14916 467 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 ATF6BQ99941 703 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 OCEL1Q9H607 264 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 TMEM212A6NML5 194 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 ZNF726A6NNF4 738 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 NEURL1O76050 574 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 PGA4P0DJD7 388 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 PGA3P0DJD8 388 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 PSMB10P40306 273 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 RRADP55042 308 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 CLRN1P58418 232 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 RAC3P60763 192 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 FOXO1Q12778 655 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 INSL4Q14641 139 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 ETFDHQ16134 617 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 HIST3H3Q16695 136 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 OR14L1PQ8NHC6 308 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 RNF128Q8TEB7 428 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 NSMAFQ92636 917 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS1-202ENST00000338546 MAP6Q96JE9 813 aa14.51□□□□□ -0.09
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