RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 OXGR1Q96P68 337 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 OR14A2Q96R54 314 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 OR8B4Q96RC9 309 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 FAM117AQ9C073 453 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 B3GNT4Q9C0J1 378 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF281Q9Y2X9 895 aa11.13□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 A0A0G2JK05 382 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ISPDA4D126 451 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 AQP7P3A6NL99 342 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 HSPB2A8KAH6 182 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 CENPBD1B2RD01 187 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 SEC14L5O43304 696 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 MPZL1O95297 269 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 UCHL1P09936 223 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 CYB561P49447 251 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 OR10A3P58181 314 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 HSPB2Q16082 182 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 IDNKQ5T6J7 187 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 HBMQ6B0K9 141 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 TRILQ7L0X0 811 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 MAP6Q96JE9 813 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 TTYH2Q9BSA4 534 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC32Q9BV29 185 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 POLE4Q9NR33 117 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 FAIMQ9NVQ4 179 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 A0A087WV48 116 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PPK0 400 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 LRRC3CA6NJW4 275 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 HPGDSO60760 199 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 RAMP1O60894 148 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ARL6IP5O75915 188 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ZFPL1O95159 310 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 SRD5A2P31213 254 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 SLC17A1Q14916 467 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 TOMM20Q15388 145 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF79Q15937 498 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 YIF1BQ5BJH7 314 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM225Q6GV28 225 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 FAM131AQ6UXB0 335 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 GPAT4Q86UL3 456 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 MINDY2Q8NBR6 621 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 NOXO1Q8NFA2 376 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 SLC26A10Q8NG04 563 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 NSMAFQ92636 917 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 NKD1Q969G9 470 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 DIRAS2Q96HU8 199 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 PIGQQ9BRB3 760 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 SRRQ9GZT4 340 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ELOVL3Q9HB03 270 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 STMN3Q9NZ72 180 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 FRRS1LQ9P0K9 344 aa11.12□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1B0GTH9 108 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 F10P00742 488 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF823P16415 610 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 PSMD7P51665 324 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 B3GALT5-AS1P59052 145 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 GABREP78334 506 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 DCAF10Q5QP82 559 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 SFXN4Q6P4A7 337 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 LRRN1Q6UXK5 716 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 HDDC2Q7Z4H3 204 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 SLC22A16Q86VW1 577 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 OR2G2Q8NGZ5 317 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 OR5AK2Q8NH90 309 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 PHYHIPQ92561 330 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 RBP7Q96R05 134 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 DEPPQ9NTK1 212 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 FAM86C1Q9NVL1 165 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 RASD1Q9Y272 281 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 TTC28Q96AY4 2481 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 OR4C45A6NMZ5 311 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF879B4DU55 563 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 WNT11O96014 354 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 IGHG1P01857 330 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 PGA4P0DJD7 388 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 PGA3P0DJD8 388 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 RAB3BP20337 219 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ITGA3P26006 1051 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 THBS2P35442 1172 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 CLRN1P58418 232 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 GPR85P60893 370 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ROM1Q03395 351 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 CAMK2DQ13557 499 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 ABHD17BQ5VST6 288 aa11.11□□□□□ -0.63
ZNF548-201ENST00000336128 SPATC1Q76KD6 591 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms