RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 GPRIN2O60269 458 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 CBR3O75828 277 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 PTGS2P35354 604 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 NUBP1P53384 320 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 FAM131AQ6UXB0 335 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 PAMR1Q6UXH9 720 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 SYT9Q86SS6 491 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 GPAT4Q86UL3 456 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 TPRA1Q86W33 373 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 IL17BQ9UHF5 180 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 TRAPPC4Q9Y296 219 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 ZNF281Q9Y2X9 895 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 A0A0G2JK05 382 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 UCHL1P09936 223 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-201ENST00000331789 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 PPP3R1P63098 170 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM225Q6GV28 225 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-201ENST00000331789 TMPPEQ6ZT21 453 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 SPATC1Q76KD6 591 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 SLC39A7Q92504 469 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-201ENST00000331789 STMN3Q9NZ72 180 aa15.99■□□□□ 0.15
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ACTB-201ENST00000331789 FABP12A6NFH5 140 aa15.98■□□□□ 0.15
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ACTB-201ENST00000331789 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 TOMM20Q15388 145 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 STPG1Q5TH74 334 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 SLC18B1Q6NT16 456 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 MZT2AQ6P582 158 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 GLRX5Q86SX6 157 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 OR8H2Q8N162 312 aa15.98■□□□□ 0.15
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ACTB-201ENST00000331789 OR8B4Q96RC9 309 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 SRRQ9GZT4 340 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 ELOVL3Q9HB03 270 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 TIGARQ9NQ88 270 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 PIN1P1O15428 100 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
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ACTB-201ENST00000331789 RAB43Q86YS6 212 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 POC5Q8NA72 575 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 SLC26A10Q8NG04 563 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 OR5AK2Q8NH90 309 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 ASB17Q8WXJ9 295 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 OXGR1Q96P68 337 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 CCDC32Q9BV29 185 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 NOX4Q9NPH5 578 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 DEPPQ9NTK1 212 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 KLHL13Q9P2N7 655 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 ACOD1A6NK06 481 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 AQP7P3A6NL99 342 aa15.97■□□□□ 0.15
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
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ACTB-201ENST00000331789 YIF1BQ5BJH7 314 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 CNIH2Q6PI25 160 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 PRSS35Q8N3Z0 413 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 OR2G2Q8NGZ5 317 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 TTYH2Q9BSA4 534 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 ABHD6Q9BV23 337 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 RASD1Q9Y272 281 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 ARL6IP5O75915 188 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 PMS2P2O95744 297 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 RFPL3SP0C7P2 107 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 FTH1P19P0C7X4 201 aa15.96■□□□□ 0.15
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