RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 ERVK13-1Q9NX77 482 aa18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 GLTPQ9NZD2 209 aa18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 SVILO95425 2214 aa18.39■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM129A0AVI4 362 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 DAPL1A0PJW8 107 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TVP23AA6NH52 213 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF724A8MTY0 619 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC43A1O75387 559 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TFP02787 698 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 OR2T7P0C7T2 308 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 LIMS3P0CW19 117 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 LIMS4P0CW20 117 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB39AQ14964 217 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 MED22Q15528 200 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF367Q7RTV3 350 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC16A9Q7RTY1 509 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR141Q7Z602 305 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 LHFPL3Q86UP9 236 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TIGD4Q8IY51 512 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 NANOGP1Q8N7R0 232 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 OR5M9Q8NGP3 310 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 OR2T27Q8NH04 317 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 NSMAFQ92636 917 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM54Q969K7 222 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 INTS14Q96SY0 518 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 MARCH7Q9H992 704 aa18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNHIT1O43257 154 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TGM6O95932 706 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 QDPRP09417 244 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMB9P28065 219 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 GLB1L2Q8IW92 636 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TMIGD2Q96BF3 282 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXN4Q96NZ1 517 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 GPANK1O95872 356 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TTKP33981 857 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 PTGS2P35354 604 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 P4HA3Q7Z4N8 544 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TUSC5Q8IXB3 177 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 C20orf196Q8IYI0 205 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHL36Q8N4N3 616 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 OR6N2Q8NGY6 317 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIB1Q96RU8 372 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF649Q9BS31 505 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC25A18Q9H1K4 315 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 GP6Q9HCN6 339 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 PARPBPQ9NWS1 579 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 CLCF1Q9UBD9 225 aa18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 A6NHS1 94 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 AHRRA9YTQ3 701 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 YES1P07947 543 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 NTF4P34130 210 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 WNT4P56705 351 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 HSF2Q03933 536 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 GALEQ14376 348 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 LRFN4Q6PJG9 635 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 FGD2Q7Z6J4 655 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC26A10Q8NG04 563 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 OR13F1Q8NGS4 319 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 OR5M11Q96RB7 305 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 ALG8Q9BVK2 526 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 ULBP2Q9BZM5 246 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR76Q9H967 626 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 CALHM2Q9HA72 323 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 BSNQ9UPA5 3926 aa18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 SEC14L2O76054 403 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 GP2P55259 537 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAM8P78325 824 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 KLRB1Q12918 225 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 19.6
PACSIN3-201ENST00000298838 SPHARQ15513 63 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TIGD6Q17RP2 521 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 OR2G6Q5TZ20 316 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 MNTQ99583 582 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 YIPF3Q9GZM5 350 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 CLEC4AQ9UMR7 237 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PPL8 197 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 HRGP04196 525 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 GAAP10253 952 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 SFTPCP11686 197 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 LAP3P28838 519 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 TDGF1P3P51864 188 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 HCCSP53701 268 aa18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF85Q03923 595 aa18.35■□□□□ 0.53
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