RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 KNTC1P50748 2209 aa20.35■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 PRR33A8MZF0 331 aa20.35■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 GPRIN2O60269 458 aa20.35■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 HPGDSO60760 199 aa20.35■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEB1P43366 347 aa20.35■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 TOMM20Q15388 145 aa20.35■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 IDNKQ5T6J7 187 aa20.35■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 FAM205BPQ63HN1 556 aa20.35■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 TMPPEQ6ZT21 453 aa20.35■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 DIRAS2Q96HU8 199 aa20.35■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 C14orf119Q9NWQ9 140 aa20.35■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 STMN3Q9NZ72 180 aa20.35■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 PHYHO14832 338 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 CYB561P49447 251 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 GPR85P60893 370 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 MADCAM1Q13477 382 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 LRRN1Q6UXK5 716 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 SYT9Q86SS6 491 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF281Q9Y2X9 895 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 PTGS2P35354 604 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 FAM131AQ6UXB0 335 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 SLC22A16Q86VW1 577 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 TPRA1Q86W33 373 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 RAB43Q86YS6 212 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 NSMAFQ92636 917 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 FAIMQ9NVQ4 179 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 TRAPPC4Q9Y296 219 aa20.34■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0G2JK05 382 aa20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 UCHL1P09936 223 aa20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 CFL1P23528 166 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 PPP3R1P63098 170 aa20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 HBMQ6B0K9 141 aa20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 SLC18B1Q6NT16 456 aa20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 DNM1P34Q6PK57 102 aa20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 PAMR1Q6UXH9 720 aa20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 SPATC1Q76KD6 591 aa20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 SLC26A10Q8NG04 563 aa20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 ORAI1Q96D31 301 aa20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 OR8B4Q96RC9 309 aa20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 DEPPQ9NTK1 212 aa20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
VSTM4-201ENST00000298454 FABP12A6NFH5 140 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 AQP7P3A6NL99 342 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 GATBO75879 557 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 WNT11O96014 354 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35A1P78382 337 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 YIF1BQ5BJH7 314 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 SFXN4Q6P4A7 337 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC32Q9BV29 185 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ELOVL3Q9HB03 270 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 FAM86C1Q9NVL1 165 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL13Q9P2N7 655 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ISPDA4D126 451 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ACOD1A6NK06 481 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 CAMK2DQ13557 499 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 DCAF10Q5QP82 559 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 SPINK14Q6IE38 97 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 EGFL6Q8IUX8 553 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 OR5AK2Q8NH90 309 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 NKD1Q969G9 470 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 OXGR1Q96P68 337 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 TTYH2Q9BSA4 534 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 SRRQ9GZT4 340 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 NOX4Q9NPH5 578 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 CENPBD1B2RD01 187 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 PIN1P1O15428 100 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ARL6IP5O75915 188 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 PMS2P2O95744 297 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 RFPL3SP0C7P2 107 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF17P17021 662 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 RAB3BP20337 219 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 OR8H2Q8N162 312 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 IL22RA1Q8N6P7 574 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 PRSS33Q8NF86 280 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 OR2G2Q8NGZ5 317 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ASB17Q8WXJ9 295 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ABHD6Q9BV23 337 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC3CA6NJW4 275 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF879B4DU55 563 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF43P17038 809 aa20.31■□□□□ 0.84
VSTM4-201ENST00000298454 THBS2P35442 1172 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms