RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.38■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 OR4K5Q8NGD3 323 aa16.38■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 OR1J2Q8NGS2 313 aa16.38■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 FAM168AQ92567 244 aa16.38■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 LRMDAQ9H2I8 198 aa16.38■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 SIAEQ9HAT2 523 aa16.38■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF224Q9NZL3 707 aa16.38■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 ARID1AO14497 2285 aa16.38■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 hCG_2039718K7EN88 272 aa16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 NDUFS8O00217 210 aa16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 DYNC1I1O14576 645 aa16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 GLRXP35754 106 aa16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 CD47Q08722 323 aa16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 FXNQ16595 210 aa16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 OR51A7Q8NH64 312 aa16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 PYURFQ96I23 114 aa16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 KCNK17Q96T54 332 aa16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 NDUFAF4Q9P032 175 aa16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 USF3Q68DE3 2245 aa16.37■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 AHCYL1O43865 530 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 PDLIM4P50479 330 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 RAB39AQ14964 217 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 ZBED5Q49AG3 693 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 KRT80Q6KB66 452 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 RNF148Q8N7C7 305 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 SLC7A13Q8TCU3 470 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 CDRT15Q96T59 188 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 DOK1Q99704 481 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 SH3GL3Q99963 347 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 CD300AQ9UGN4 299 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 MTORP42345 2549 aa16.36■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 CADP27708 2225 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 RPL4P36578 427 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 MXRA7P84157 204 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 MYBPC1Q00872 1141 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 TBPL2Q6SJ96 375 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF525Q8N782 197 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 LRRC75AQ8NAA5 344 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF540Q8NDQ6 660 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 SLC30A7Q8NEW0 376 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 C10orf105Q8TEF2 133 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 C7orf34Q96L11 122 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 CCT8L2Q96SF2 557 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 DYNLRB1Q9NP97 96 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 GRHPRQ9UBQ7 328 aa16.35■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 TRAV27A0A087WT01 109 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 XKRYO14609 159 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 CD14P08571 375 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 PATE4P0C8F1 98 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 SELENOVP59797 346 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 TBC1D28Q2M2D7 210 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 FGD3Q5JSP0 725 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 PODNL1Q6PEZ8 512 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 SVOPLQ8N434 492 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 OR13C2Q8NGS9 318 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 HTRA1Q92743 480 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 SORCS2Q96PQ0 1159 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 WACQ9BTA9 647 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 MS4A5Q9H3V2 200 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 CDH20Q9HBT6 801 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 AURKCQ9UQB9 309 aa16.34■□□□□ 0.21
MALSU1-201ENST00000287543 ACANP16112 2415 aa16.33■□□□□ 0.2
MALSU1-201ENST00000287543 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa16.33■□□□□ 0.2
MALSU1-201ENST00000287543 SLC2A10O95528 541 aa16.33■□□□□ 0.2
MALSU1-201ENST00000287543 SNAP29O95721 258 aa16.33■□□□□ 0.2
MALSU1-201ENST00000287543 FUT4P22083 530 aa16.33■□□□□ 0.2
MALSU1-201ENST00000287543 RAD52P43351 418 aa16.33■□□□□ 0.2
MALSU1-201ENST00000287543 GPR4P46093 362 aa16.33■□□□□ 0.2
MALSU1-201ENST00000287543 PCBD1P61457 104 aa16.33■□□□□ 0.2
MALSU1-201ENST00000287543 HSF2Q03933 536 aa16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 161.4 ms