RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 LGALS8O00214 317 aa20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 CLDN4O14493 209 aa20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS27P42677 84 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 ERV3-1Q14264 604 aa20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB11BQ15907 218 aa20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 CBLN3Q6UW01 205 aa20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 OTOSQ8NHW6 89 aa20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 LMF1Q96S06 567 aa20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 MFFQ9GZY8 342 aa20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 EXO5Q9H790 373 aa20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM138Q9NPI0 162 aa20.03■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 HEATR5AQ86XA9 2040 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 CCINQ13939 588 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 MED25Q71SY5 747 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 C5orf42Q9H799 3197 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 OR5K4A6NMS3 321 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 PMS2P2O95744 297 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 HPP00738 406 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TNFP01375 233 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 ODF4Q2M2E3 257 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF524Q96C55 264 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 OR8B4Q96RC9 309 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 PRODH2Q9UF12 536 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1-201ENST00000218364 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.02■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 D6RAR5 112 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 SULT1C2O00338 296 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 ACTBP60709 375 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 SKP1P63208 163 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 ACTG1P63261 375 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 SORDQ00796 357 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 C4orf46Q504U0 113 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 Q6ZSR6 202 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 GABRG1Q8N1C3 465 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 STPG2Q8N412 459 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF454Q8N9F8 522 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 SYT4Q9H2B2 425 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 EPHA6Q9UF33 1036 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2W5A6NFC9 320 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 SDC3O75056 442 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 CCR4P51679 360 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 SHHQ15465 462 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC107Q8WV48 283 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 UPB1Q9UBR1 384 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 LRP4O75096 1905 aa20.01■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 MEIS3P1A6NDR6 274 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF264O43296 627 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 MAOAP21397 527 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNAB1Q14722 419 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC17A1Q14916 467 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 ASPHD2Q6ICH7 369 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 OR52H1Q8NGJ2 320 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 MRGPRX1Q96LB2 322 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC25A32Q9H2D1 315 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNG2Q9UJ96 466 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 H3BSH0 61 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 AKT2P31751 481 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 TAS2R19P59542 299 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 C11orf88Q6PI97 169 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM229BQ8NBD8 167 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 AVL9Q8NBF6 648 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 EDAQ92838 391 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 TAAR8Q969N4 342 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC25A28Q96A46 364 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNK15Q9H427 330 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 POFUT1Q9H488 388 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 ELOVL3Q9HB03 270 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR160Q9UJ42 338 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 DOCK8Q8NF50 2099 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 IL33O95760 270 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 GPANK1O95872 356 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 CA3P07451 260 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 HPGDP15428 266 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 CCKBRP32239 447 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 GALNSP34059 522 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 TEX30Q5JUR7 227 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 LY6G6FQ5SQ64 297 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGAP40Q5TG30 622 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 PM20D2Q8IYS1 436 aa20■□□□□ 0.79
HTATSF1-201ENST00000218364 DUSP19Q8WTR2 217 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms