RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHG1P01857 330 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CPN1P15169 458 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CENPAP49450 140 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 WNT4P56705 351 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTC1P68032 377 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTA1P68133 377 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMK2DQ13557 499 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ZIC4Q8N9L1 334 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF511Q8NB15 262 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF485Q8NCK3 441 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 NOXO1Q8NFA2 376 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10H4Q8NGA5 316 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 EXTL1Q92935 676 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TAAR6Q96RI8 345 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 MGLLQ99685 303 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 MARCH7Q9H992 704 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087WV48 116 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 DAPL1A0PJW8 107 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF726A6NNF4 738 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 CYTIPO60759 359 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2T7P0C7T2 308 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 FMODQ06828 376 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 GALEQ14376 348 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 ETFDHQ16134 617 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2G6Q5TZ20 316 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR107Q5VW38 600 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 FCRLAQ7L513 359 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35F2Q8IXU6 374 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TIGD4Q8IY51 512 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2T27Q8NH04 317 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 YIPF6Q96EC8 236 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TBX5Q99593 518 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMA5O15230 3695 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GVC2 190 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CENPBD1B2RD01 187 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 TAF4O00268 1085 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QTNF9P0C862 333 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CD79BP40259 229 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 BLVRAP53004 296 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CLRN1P58418 232 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF85Q03923 595 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST3H3Q16695 136 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMCX4Q5H9R4 360 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 THEM4Q5T1C6 240 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 DNM1P34Q6PK57 102 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SIAH3Q8IW03 269 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL36Q8N4N3 616 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52N1Q8NH53 320 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 WDYHV1Q96HA8 205 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 RBP7Q96R05 134 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF407Q9C0G0 2248 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC160A6NGH7 325 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 LIPAP38571 399 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 HCCSP53701 268 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC16A9Q7RTY1 509 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ALG8Q9BVK2 526 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 FUNDC2Q9BWH2 189 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 TVP23AA6NH52 213 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 GPANK1O95872 356 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 HSMCR30P0CW71 290 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 PTGS2P35354 604 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 TGFBR2P37173 567 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 FNDC8Q8TC99 324 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 GATAD2BQ8WXI9 593 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 OPALINQ96PE5 141 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2M2Q96R28 347 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 PLSCR2Q9NRY7 297 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 LHX6Q9UPM6 363 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF432O94892 652 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SCG5P05408 212 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CXADRP78310 365 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 GLO1Q04760 184 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 INAQ16352 499 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 C3AR1Q16581 482 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CARD17Q5XLA6 110 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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