RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RASD2Q96D21 266 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LEFTY1O75610 366 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HOXB2P14652 356 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GTDC1Q4AE62 458 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FEZF1A0PJY2 475 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ABCD3P28288 659 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GDNFP39905 211 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FLT3LGP49771 235 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 F2RL3Q96RI0 385 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 C12orf57Q99622 126 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RARRES3Q9UL19 164 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SULT2B1O00204 365 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SLC16A7O60669 478 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CNIH1O95406 144 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CPNE6O95741 557 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 COX5AP20674 150 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SPCS3P61009 180 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF85Q03923 595 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZP2Q05996 745 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF626Q68DY1 528 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CBLL1Q75N03 491 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 RHOFQ9HBH0 211 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 DLL4Q9NR61 685 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 INSL6Q9Y581 213 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM221A6NGB7 291 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 UMAD1C9J7I0 102 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TCRBP04435 133 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MMP15P51511 669 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GPR17Q13304 367 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MFSD4AQ8N468 514 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 YKT6O15498 198 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OR3A1P47881 315 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC26Q2I0M4 334 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 APIPQ96GX9 242 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OLAHQ9NV23 265 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GLAP06280 429 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF44P15621 663 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 FPGSQ05932 587 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SIAH3Q8IW03 269 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ACPTQ9BZG2 426 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0B4J2A0 478 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0U1RQF3 1178 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NAGAP17050 411 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GCAP28676 217 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 WDR92Q96MX6 357 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SGPP1Q9BX95 441 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NMES1Q9C002 83 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 M0R2Z0 102 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ABHD16AO95870 558 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 GSX2Q9BZM3 304 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A6P12236 298 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRT-209ENST00000612229 CR2P20023 1033 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms