RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 SVOPLQ8N434 492 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 OR9Q2Q8NGE9 314 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 OR51A7Q8NH64 312 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ASB10Q8WXI3 467 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 MBD6Q96DN6 1003 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 POM121Q96HA1 1249 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 TXNDC15Q96J42 360 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 GPA33Q99795 319 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ALG12Q9BV10 488 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 MED29Q9NX70 200 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 IL20Q9NYY1 176 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 UPB1Q9UBR1 384 aa8.7□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 PRSS50Q9UI38 385 aa8.7□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 A6NIZ1 184 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 MCIDASD6RGH6 385 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 H3BNX3 289 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ARPC3O15145 178 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 SIAH2O43255 324 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 IDH3BO43837 385 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 TPPPO94811 219 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ATE1O95260 518 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 TXNDC12O95881 172 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 IGHG1P01857 330 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 F13BP05160 661 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 PGA4P0DJD7 388 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 PGA3P0DJD8 388 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 CRYGSP22914 178 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 IGHV1-2P23083 117 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 SDHAP31040 664 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 SLC6A6P31641 620 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ERFP50548 548 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 BIDP55957 195 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ARPC4P59998 168 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 CTXN1P60606 82 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 RAP1BP61224 184 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 RAP1AP62834 184 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 TUBA4AP68366 448 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 TGFBR3Q03167 851 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 KEAP1Q14145 624 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ACKR1Q16570 336 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ZNF627Q7L945 461 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 FAM122BQ7Z309 247 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 P2RY8Q86VZ1 359 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 AQP11Q8NBQ7 271 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ZNF519Q8TB69 540 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 FANK1Q8TC84 345 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 TMEM54Q969K7 222 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ZNF566Q969W8 418 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 FEVQ99581 238 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 OR52D1Q9H346 318 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.69□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 G3V2T6 193 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ENTPD5O75356 428 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 UPK3AO75631 287 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 KRT33AO76009 404 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 THBDP07204 575 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 ITGA5P08648 1049 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 S100A1P23297 94 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 GSTT1P30711 240 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 RPL4P36578 427 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 CSNK1A1P48729 337 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 FAPQ12884 760 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 LSAMPQ13449 338 aa8.68□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.68□□□□□ -1.02
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