RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570360.1

ITGAE-202, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 2

Gene ITGAE, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-202ENST00000570360 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 AHCYL1O43865 530 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 IFNGP01579 166 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 IGHV3-9P01782 118 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF3P17036 446 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 OPRM1P35372 400 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 CDC42P60953 191 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 FMODQ06828 376 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 LRFN4Q6PJG9 635 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF100Q8IYN0 542 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 HCAR1Q9BXC0 346 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 TEX12Q9BXU0 123 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF226Q9NYT6 803 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 GLTPQ9NZD2 209 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 MALT1Q9UDY8 824 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 PROCRQ9UNN8 238 aa15.07■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 HCFC1P51610 2035 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 FAM183AA6NL82 134 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 M0R3G1 203 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 DCTN6O00399 190 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 RENP00797 406 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 CD8BP10966 210 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 GABRB1P18505 474 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 BMP5P22003 454 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 CD47Q08722 323 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 ITGADQ13349 1161 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 ENTHD1Q8IYW4 607 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 POMGNT2Q8NAT1 580 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 OR6N1Q8NGY5 312 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 TMEM163Q8TC26 289 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 MCHR2Q969V1 340 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 PLEKHA8Q96JA3 519 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 MUS81Q96NY9 551 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 TSSK2Q96PF2 358 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 IL4I1Q96RQ9 567 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 MED20Q9H944 212 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 IMPAD1Q9NX62 359 aa15.06■□□□□ 0
ITGAE-202ENST00000570360 OR6C65A6NJZ3 312 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 CTLA4P16410 223 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 SLC25A1P53007 311 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 IL18R1Q13478 541 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 C10orf128Q5T292 105 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 FBXW9Q5XUX1 488 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 PLBD1Q6P4A8 553 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 CPOQ8IVL8 374 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 GPR137CQ8N3F9 429 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 BBS1Q8NFJ9 593 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 OR8J1Q8NGP2 316 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 APOL4Q9BPW4 351 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 ANKRD60Q9BZ19 345 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 ULBP2Q9BZM5 246 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 PIGMQ9H3S5 423 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 GPR35Q9HC97 309 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 JKAMPQ9P055 326 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 RAB26Q9ULW5 256 aa15.05■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 DVL2O14641 736 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 MSTNO14793 375 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 QDPRP09417 244 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 CLUP10909 449 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 NR2C1P13056 603 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 CHRNB4P30926 498 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 ISL1P61371 349 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 THEM4Q5T1C6 240 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 MTFR2Q6P444 385 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 OR6V1Q8N148 313 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 DEPDC4Q8N2C3 294 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 RHOXF1Q8NHV9 184 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 FNDC8Q8TC99 324 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 ZNRF4Q8WWF5 429 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 PTP4A1Q93096 173 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 NUAK2Q9H093 628 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 CRLF2Q9HC73 371 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 ASB6Q9NWX5 421 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 AASSQ9UDR5 926 aa15.04■□□□□ -0
ITGAE-202ENST00000570360 FKBP7Q9Y680 259 aa15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms