RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	MCHR2	Q969V1	340 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	CA10	Q9NS85	328 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996		V9GYQ6	96 aa		18.1	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	CDC42EP2	O14613	210 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	DIRAS1	O95057	198 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	SEMG1	P04279	462 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	GPR4	P46093	362 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ALG10	Q5BKT4	473 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	BDH2	Q9BUT1	245 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		18.09	■□□□□ 0.49
CS-222	ENST00000550996	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ARPC2	O15144	300 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ACADS	P16219	412 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	GIPR	P48546	466 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	RIPPLY3	P57055	190 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	CLRN1	P58418	232 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	KRT72	Q14CN4	511 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ADIPOQ	Q15848	244 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	GSG1	Q2KHT4	349 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	OR51A7	Q8NH64	312 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	FBXO17	Q96EF6	278 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SH3GL3	Q99963	347 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		18.08	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PRQ8	180 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996		H7C417	338 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SLC2A10	O95528	541 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	LY6G6D	O95868	133 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	FAM107A	O95990	144 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	IGHM	P01871	453 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	FMOD	Q06828	376 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	DGCR6	Q14129	220 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SEC23B	Q15437	767 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ETFDH	Q16134	617 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	VHLL	Q6RSH7	139 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	NUP37	Q8NFH4	326 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	KCNK17	Q96T54	332 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	FUZ	Q9BT04	418 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		18.07	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	CENPBD1	B2RD01	187 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	OR4A8	P0C604	315 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	RHCE	P18577	417 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	THBS4	P35443	961 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SERPINF1	P36955	418 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	RAB1A	P62820	205 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	MSMP	Q1L6U9	139 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	C10orf128	Q5T292	105 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	OAF	Q86UD1	273 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ZNF519	Q8TB69	540 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	PYURF	Q96I23	114 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	SSX4	O60224	188 aa		18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	LY6H	O94772	140 aa		18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		18.05	■□□□□ 0.48
CS-222	ENST00000550996	ZNF35	P13682	527 aa		18.05	■□□□□ 0.48

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