RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	RORC	P51449	518 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	UBE2H	P62256	183 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	IL24	Q13007	206 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125		Q6ZR03	302 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ABHD13	Q7L211	337 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	SGK2	Q9HBY8	427 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	NPTN	Q9Y639	398 aa		2.55	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	GAK	O14976	1311 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	CLRN2	A0PK11	232 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	BTBD17	A6NE02	478 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF726	A6NNF4	738 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125		H0YHG0	523 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	DYNC1I1	O14576	645 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	FOXH1	O75593	365 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	CISD3	P0C7P0	127 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	CALM1	P0DP23	149 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	CALM2	P0DP24	149 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	CALM3	P0DP25	149 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	VHL	P40337	213 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	HNMT	P50135	292 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	FBXW4	P57775	412 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	SEC61G	P60059	68 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	RAP1A	P62834	184 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF92	Q03936	586 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	GINS1	Q14691	196 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	STK11	Q15831	433 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF77	Q15935	545 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	RNF182	Q8N6D2	247 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	SH3GL1	Q99961	368 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		2.54	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	WDR62	O43379	1518 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	HIDE1	A8MVS5	230 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	SOX15	O60248	233 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	GABARAP	O95166	117 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	FABP3	P05413	133 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ETS2	P15036	469 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	PSMC3	P17980	439 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	NPY1R	P25929	384 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	SERPINB5	P36952	375 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ERCC8	Q13216	396 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	PON3	Q15166	354 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	LY6E	Q16553	131 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM135	Q86UB9	458 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	STPG2	Q8N412	459 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF709	Q8N972	641 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM54	Q969K7	222 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	PDXP	Q96GD0	296 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	C12orf42	Q96LP6	360 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00477	Q96M19	166 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	GON7	Q9BXV9	100 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	OPN4	Q9UHM6	478 aa		2.53	□□□□□ -2
MDM2-231	ENST00000544125	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125		A0A1B0GVX0	72 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	GOSR2	O14653	212 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	PSTPIP1	O43586	416 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	VAMP5	O95183	116 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	C1orf105	O95561	183 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	FOLR1	P15328	257 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	NAMPT	P43490	491 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	CDKN1B	P46527	198 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	KRTAP10-10	P60014	251 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	KRTAP10-1	P60331	282 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	TCP10	Q12799	353 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	CHIT1	Q13231	466 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	POU2AF1	Q16633	256 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	BIVM	Q86UB2	503 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	OAF	Q86UD1	273 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		2.52	□□□□□ -2.01
MDM2-231	ENST00000544125	P2RX4	Q99571	388 aa		2.52	□□□□□ -2.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms