RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.04□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 NEU3Q9UQ49 428 aa7.04□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 A0A1B0GW15 77 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 OOEPA6NGQ2 149 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 STX16O14662 325 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 ARPC3O15145 178 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 ZNF264O43296 627 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 RNF13O43567 381 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 KDELR3O43731 214 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 STK17BO94768 372 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 IGSF6O95976 241 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 RRASP10301 218 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 CYP4B1P13584 511 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 ACADLP28330 430 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 NDUFS1P28331 727 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 S100A11P31949 105 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 RFC3P40938 356 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 TMEM33P57088 247 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 PITPNAQ00169 270 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 BDH1Q02338 343 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 FOXM1Q08050 763 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 MICAQ29983 383 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 FGD3Q5JSP0 725 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 CLLU1Q5K131 121 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 CEACAM20Q6UY09 585 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 NAPRTQ6XQN6 538 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 COMMD7Q86VX2 200 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 PARP8Q8N3A8 854 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 POC5Q8NA72 575 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 OR56A3Q8NH54 315 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 PATE1Q8WXA2 126 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 CDS1Q92903 461 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 ISOC1Q96CN7 298 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 ROGDIQ9GZN7 287 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 ACTL8Q9H568 366 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 NT5DC2Q9H857 520 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 TAAR2Q9P1P5 351 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 PKP3Q9Y446 797 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 POLEQ07864 2286 aa7.02□□□□□ -1.28
LMO3-212ENST00000535535 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 ADAM10O14672 748 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 SIGLEC5O15389 551 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 RAMP3O60896 148 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 UGT2B17O75795 530 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 GSTM3P21266 225 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 GPD1P21695 349 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 AK4P27144 223 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 DDTP30046 118 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 PTGER4P35408 488 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 CDH11P55287 796 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 RAP1AP62834 184 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 PNOCQ13519 176 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 RAB39AQ14964 217 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 PGS1Q32NB8 556 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 TRNP1Q6NT89 227 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 ARCQ7LC44 396 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 SKA3Q8IX90 412 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 PELI3Q8N2H9 469 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 GATSQ8NAP1 163 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms