RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF85	Q03923	595 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	FOXO1	Q12778	655 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CDC20	Q12834	499 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SYS1	Q8N2H4	156 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	FNDC8	Q8TC99	324 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TM9SF4	Q92544	642 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	PINLYP	A6NC86	204 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	PHYH	O14832	338 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TACSTD2	P09758	323 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	NR2C1	P13056	603 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CEL	P19835	753 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	GABRA5	P31644	462 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CARD18	P57730	90 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	GLO1	Q04760	184 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF511	Q8NB15	262 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	MDS2	Q8NDY4	140 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	INTS14	Q96SY0	518 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	MED29	Q9NX70	200 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610		A0A0J9YW62	118 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TNFSF11	O14788	317 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TF	P02787	698 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	HPN	P05981	417 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CD79B	P40259	229 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	PEX19	P40855	299 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	MEOX1	P50221	254 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	HCCS	P53701	268 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CLRN1	P58418	232 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	RAC3	P60763	192 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	HBM	Q6B0K9	141 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	NDNF	Q8TB73	568 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TXNDC15	Q96J42	360 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	KCNK17	Q96T54	332 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	COQ7	Q99807	217 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	WDR76	Q9H967	626 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TVP23A	A6NH52	213 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ACOT7	O00154	380 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	DCTN6	O00399	190 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	IGHG1	P01857	330 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	HLA-DPB1	P04440	258 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CD53	P19397	219 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ENPP1	P22413	925 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	P2RY4	P51582	365 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TRAM1	Q15629	374 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF766	Q5HY98	468 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	THEM4	Q5T1C6	240 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TIGD4	Q8IY51	512 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SYT14	Q8NB59	555 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	OR6X1	Q8NH79	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	HES7	Q9BYE0	225 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	MARCH7	Q9H992	704 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	GPX5	O75715	221 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF823	P16415	610 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CRYBB2	P43320	205 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CD97	P48960	835 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	OR12D2	P58182	307 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	H3F3A	P84243	136 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	CDON	Q4KMG0	1287 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ATG13-222	ENST00000534610	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		13.72	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms