RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 THEGLP0DJG4 465 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM225BP0DP42 221 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC26A5P58743 744 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TFF2Q03403 129 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 Q499Y3 187 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 C1QL3Q5VWW1 255 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 OR4D10Q8NGI6 311 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ANGPTL6Q8NI99 470 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 DIO2Q92813 273 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CMC2Q9NRP2 79 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CPNE7Q9UBL6 633 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CHD5Q8TDI0 1954 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TTLL8A6PVC2 850 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 GPR31O00270 319 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CTSVO60911 334 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 EML2O95834 649 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TNFP01375 233 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PSMA3P25788 255 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC6A1P30531 599 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 UBE2NLQ5JXB2 153 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF529Q6P280 563 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CBLN2Q8IUK8 224 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 MISPQ8IVT2 679 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 LRRC18Q8N456 261 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 RCBTB1Q8NDN9 531 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PXT1Q8NFP0 134 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC41A2Q96JW4 573 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 LRRC3BQ96PB8 259 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 MED29Q9NX70 200 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 DAPP1Q9UN19 280 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 LY75O60449 1722 aa11.31□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 OR6C68A6NDL8 312 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 OR8U9P0C7N5 309 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 OR2T7P0C7T2 308 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CD80P33681 288 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 EMP2P54851 167 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CDK5R1Q15078 307 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PDCD1Q15116 288 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PRAMEF20Q5VT98 475 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM81Q6P7N7 255 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF679Q8IYX0 411 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 OR2T27Q8NH04 317 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ZPLD1Q8TCW7 415 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 MYADMQ96S97 322 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 NIT2Q9NQR4 276 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TAS2R4Q9NYW5 299 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ATPIF1Q9UII2 106 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 SYT5O00445 386 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 P2RX6O15547 441 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAPPC6AO75865 159 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 S100A2P29034 98 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 HMGA2P52926 109 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TLE3Q04726 772 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAM1Q15629 374 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ETFDHQ16134 617 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 FXNQ16595 210 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CDKN3Q16667 212 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 GSG1Q2KHT4 349 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 AADACL4Q5VUY2 407 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC18B1Q6NT16 456 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CBLN3Q6UW01 205 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TPRA1Q86W33 373 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PHB2Q99623 299 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 BIN3Q9NQY0 253 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 IL20Q9NYY1 176 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAPPC4Q9Y296 219 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM200CA6NKL6 621 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 RGS13O14921 159 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PAPLNO95428 1278 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 EPHA1P21709 976 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CBX5P45973 191 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ACTBP60709 375 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ACTG1P63261 375 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM71Q6P5X7 295 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 SERINC2Q96SA4 455 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 BTBD2Q9BX70 525 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa11.3□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa11.29□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 IFNA21P01568 189 aa11.29□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 CT62P0C5K7 136 aa11.29□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 EDN3P14138 238 aa11.29□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 ST6GAL1P15907 406 aa11.29□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PPP3CBP16298 524 aa11.29□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PRKAR1BP31321 381 aa11.29□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 P2RX1P51575 399 aa11.29□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.29□□□□□ -0.6
TRIOBP-211ENST00000492485 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms