RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486260.5

THBS3-207, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 5

Gene THBS3, Length 1,763 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-207ENST00000486260 CCL21O00585 134 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 UPK3AO75631 287 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 TNFSF13O75888 250 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 IGHV3-9P01782 118 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 CLUP10909 449 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 PAICSP22234 425 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 FMODQ06828 376 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 HIST3H3Q16695 136 aa14.62□□□□□ -0.07
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THBS3-207ENST00000486260 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 TMEM54Q969K7 222 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 APH1AQ96BI3 265 aa14.62□□□□□ -0.07
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THBS3-207ENST00000486260 SNX18Q96RF0 628 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 NUAK2Q9H093 628 aa14.62□□□□□ -0.07
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THBS3-207ENST00000486260 GLTPQ9NZD2 209 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.62□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 Q9UFV3 132 aa14.62□□□□□ -0.07
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THBS3-207ENST00000486260 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.62□□□□□ -0.07
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THBS3-207ENST00000486260 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.61□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.61□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 PRR7Q8TB68 274 aa14.61□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 APH1BQ8WW43 257 aa14.61□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 MCHR2Q969V1 340 aa14.61□□□□□ -0.07
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THBS3-207ENST00000486260 OR51V1Q9H2C8 321 aa14.61□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 ASB6Q9NWX5 421 aa14.61□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 RELNP78509 3460 aa14.61□□□□□ -0.07
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THBS3-207ENST00000486260 SLC16A7O60669 478 aa14.6□□□□□ -0.07
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THBS3-207ENST00000486260 OR3A2P47893 321 aa14.6□□□□□ -0.07
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THBS3-207ENST00000486260 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.6□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 STARD4Q96DR4 205 aa14.6□□□□□ -0.07
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THBS3-207ENST00000486260 PRSS50Q9UI38 385 aa14.6□□□□□ -0.07
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THBS3-207ENST00000486260 CDK5R2Q13319 367 aa14.6□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 MED21Q13503 144 aa14.6□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 KLHL12Q53G59 568 aa14.6□□□□□ -0.07
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THBS3-207ENST00000486260 OCLNQ16625 522 aa14.59□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.59□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.59□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.59□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 KRT80Q6KB66 452 aa14.59□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.59□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.59□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 OR2T4Q8NH00 348 aa14.59□□□□□ -0.07
THBS3-207ENST00000486260 FNDC8Q8TC99 324 aa14.59□□□□□ -0.07
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