RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	RAD23A	P54725	363 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	MYBPC1	Q00872	1141 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	RUNX1T1	Q06455	604 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	SLC34A1	Q06495	639 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	FAM27E3	Q08E93	113 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	NPRL3	Q12980	569 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	TMED1	Q13445	227 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	DAG1	Q14118	895 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	PCK2	Q16822	640 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	SLC36A3	Q495N2	470 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	TEX30	Q5JUR7	227 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	NIPAL3	Q6P499	406 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	MCHR2	Q969V1	340 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	C14orf79	Q96F83	325 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	RADIL	Q96JH8	1075 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	SAMD8	Q96LT4	415 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	IFT27	Q9BW83	186 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	CRLF2	Q9HC73	371 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	NGB	Q9NPG2	151 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	MED29	Q9NX70	200 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	UPB1	Q9UBR1	384 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	MOK	Q9UQ07	419 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	C11orf98	E9PRG8	122 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	PRODH	O43272	600 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	ICMT	O60725	284 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	TMCC2	O75069	709 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	KRT33A	O76009	404 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	WNT11	O96014	354 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	IFNG	P01579	166 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	IGKV3-15	P01624	115 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	IGLV1-44	P01699	117 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	QDPR	P09417	244 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	RNF224	P0DH78	156 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	CRYGS	P22914	178 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	TUBG1	P23258	451 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	IGFBP5	P24593	272 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	EDNRA	P25101	427 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	NOS3	P29474	1203 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	CCKAR	P32238	428 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	KIR2DL3	P43628	341 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF84	P51523	738 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	NR1H2	P55055	460 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	CLRN1	P58418	232 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	PCBD1	P61457	104 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	ERVK-25	P63136	954 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	SIRPA	P78324	504 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	GLO1	Q04760	184 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	FAP	Q12884	760 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	CAMK2D	Q13557	499 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	GINS1	Q14691	196 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	PGGHG	Q32M88	737 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	MEST	Q5EB52	335 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	C12orf73	Q69YU5	71 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NFX1-205	ENST00000466359	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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