RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402555.2

HMGB1P20-201, Transcript of high mobility group box 1 pseudogene 20, humanhuman

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Gene HMGB1P20, Length 677 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P20-201ENST00000402555 POFUT2Q9Y2G5 429 aa5.01□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 TMCC2O75069 709 aa5□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 ZNF544Q6NX49 715 aa5□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 ZNF525Q8N782 197 aa5□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 HIST1H2ACQ93077 130 aa5□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 FOXB1Q99853 325 aa5□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 KCNS3Q9BQ31 491 aa5□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 REG4Q9BYZ8 158 aa5□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 ZNF224Q9NZL3 707 aa5□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 A0A1W2PRG6 482 aa4.99□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 DHHO43323 396 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 TRMUO75648 421 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 SLC2A10O95528 541 aa4.99□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 QDPRP09417 244 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 OR4A8P0C604 315 aa4.99□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 PGA3P0DJD8 388 aa4.99□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 PCSK6P29122 969 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 PRDX6P30041 224 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 THBS4P35443 961 aa4.99□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 ARR3P36575 388 aa4.99□□□□□ -1.61
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HMGB1P20-201ENST00000402555 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 NUDT6P53370 316 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 CLRN1P58418 232 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 FMODQ06828 376 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 ST3GAL3Q11203 375 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 RAB39AQ14964 217 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 RAB35Q15286 201 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 ADIPOQQ15848 244 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 MSMPQ1L6U9 139 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 GSG1Q2KHT4 349 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 KRT80Q6KB66 452 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 TBPL2Q6SJ96 375 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 DNM1P46Q6ZS02 220 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 FKBP9P1Q75LS8 142 aa4.99□□□□□ -1.61
HMGB1P20-201ENST00000402555 CBLL1Q75N03 491 aa4.99□□□□□ -1.61
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