RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401029.3

CAPNS1P1-201, Transcript of calpain small subunit 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CAPNS1P1, Length 633 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF208O43345 1280 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 HCRTR2O43614 444 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 F13BP05160 661 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ABCD3P28288 659 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CRABP1P29762 137 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 HOXA6P31267 233 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PTGS2P35354 604 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PTH2RP49190 550 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 EFNA3P52797 238 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RAP1BP61224 184 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RAP1AP62834 184 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RNF4P78317 190 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 DGCR2P98153 550 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CD83Q01151 205 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 DMWDQ09019 674 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PLCXD2Q0VAA5 305 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KCNAB1Q14722 419 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GSG1Q2KHT4 349 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 Q5BKY6 102 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LINGO2Q7L985 606 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SYT9Q86SS6 491 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 DEFB119Q8N690 84 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GATSQ8NAP1 163 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 HSD17B8Q92506 261 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 HGDQ93099 445 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 C8orf44Q96CB5 159 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZFP3Q96NJ6 502 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 OR51J1Q9H342 316 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FGF21Q9NSA1 209 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TAS2R10Q9NYW0 307 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PISDQ9UG56 409 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TMED7Q9Y3B3 224 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KNL1Q8NG31 2342 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 THADAQ6YHU6 1953 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MEGF11A6BM72 1044 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 IDSB3KWA1 339 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ACOT7O00154 380 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 XKRYO14609 159 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 XRCC3O43542 346 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC25A12O75746 678 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KRT33AO76009 404 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ALX3O95076 343 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 AKR7A3O95154 331 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TGM6O95932 706 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 HRGP04196 525 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 IL5P05113 134 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CD3GP09693 182 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SULT1A3P0DMM9 295 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SULT1A4P0DMN0 295 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ADRA2CP18825 462 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms