RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 FMODQ06828 376 aa16.03■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 STEAP3Q658P3 488 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 NHLRC1Q6VVB1 395 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 PIP4P1Q86T03 277 aa16.03■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PRS3 328 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 KIR3DP1A8MWS1 328 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ZNF814B7Z6K7 855 aa16.02■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 OXA1LQ15070 435 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 DDI2Q5TDH0 399 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 BEST3Q8N1M1 668 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 TEX19Q8NA77 164 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 OTOSQ8NHW6 89 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 RPS4Y2Q8TD47 263 aa16.02■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
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ACTB-201ENST00000331789 NPIPB4C9JG80 1138 aa16.01■□□□□ 0.15
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ACTB-201ENST00000331789 RAET1LQ5VY80 246 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa16■□□□□ 0.15
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ACTB-201ENST00000331789 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 TMEM41AQ96HV5 264 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 MAP6Q96JE9 813 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 C14orf119Q9NWQ9 140 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 FRRS1LQ9P0K9 344 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 OR2M5A3KFT3 312 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 SULT2B1O00204 365 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-201ENST00000331789 PHYHO14832 338 aa16■□□□□ 0.15
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