RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 OR4Q3Q8NH05 313 aa11.65□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 RASD2Q96D21 266 aa11.65□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ULBP2Q9BZM5 246 aa11.65□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CRLF2Q9HC73 371 aa11.65□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 GPR35Q9HC97 309 aa11.65□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 A1L4Q6 167 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS37A4D1T9 235 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SOCS2O14508 198 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 EI24O14681 340 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ARHGEF9O43307 516 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 LYZL6O75951 148 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 NOS3P29474 1203 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ALDH3A2P51648 485 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CDK5Q00535 292 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 TGFBR3Q03167 851 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CEACAM16Q2WEN9 425 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 PGGHGQ32M88 737 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 C10orf128Q5T292 105 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SLC27A4Q6P1M0 643 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 LRFN4Q6PJG9 635 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF627Q7L945 461 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CBR4Q8N4T8 237 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 STEAP2Q8NFT2 490 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 MCHR2Q969V1 340 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 EME1Q96AY2 570 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 MUS81Q96NY9 551 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A19Q9HC21 320 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SLC22A23A1A5C7 686 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 DHHO43323 396 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 MITFO75030 526 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 QDPRP09417 244 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 PPP3CBP16298 524 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 IL32P24001 234 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 GRK5P34947 590 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 GIPRP48546 466 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CRISP1P54107 249 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CD47Q08722 323 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 GABRA6Q16445 453 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 THEM4Q5T1C6 240 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 OR7E24Q6IFN5 339 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 PTCHD4Q6ZW05 846 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 C17orf78Q8N4C9 275 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SYT14Q8NB59 555 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 OR1K1Q8NGR3 316 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 RBP7Q96R05 134 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 DDOQ99489 341 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 GABARAPL3Q9BY60 117 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 C8orf4Q9NR00 106 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CIB4A0PJX0 185 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 H7C1C5 153 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 MGRN1O60291 552 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 RAD51DO75771 328 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 POU1F1P28069 291 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 LCN6P62502 163 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 MYBPC1Q00872 1141 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 FMODQ06828 376 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 RIPK1Q13546 671 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 GINS1Q14691 196 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 TRIP10Q15642 601 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 TSC22D1Q15714 1073 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 NRN1LQ496H8 165 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SSX8Q7RTT4 187 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 P2RY8Q86VZ1 359 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 JAZF1Q86VZ6 243 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 IQCF1Q8N6M8 205 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 OR52E2Q8NGJ4 325 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 OR4K13Q8NH42 304 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 S100PBPQ96BU1 408 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 NMNAT3Q96T66 252 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SLC29A1Q99808 456 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 FOXB1Q99853 325 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ACTR6Q9GZN1 396 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SYT4Q9H2B2 425 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 NELFAQ9H3P2 528 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 CMC2Q9NRP2 79 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 KLHL21Q9UJP4 597 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 TUBAL3A6NHL2 446 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 OR5H1A6NKK0 313 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 ZAR1LA6NP61 321 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 SLC2A10O95528 541 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 RENP00797 406 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC42-201ENST00000293845 HMGN1P05114 100 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms