RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TM9SF2Q99805 663 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MFRPQ9BY79 579 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RERGLQ9H628 205 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FAIMQ9NVQ4 179 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FKBP7Q9Y680 259 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CACNA1CQ13936 2221 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5H15A6NDH6 313 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NPIPA5E9PKD4 350 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC16A7O60669 478 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CELA3AP09093 270 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CELP19835 753 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GDF1P27539 372 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 DAP3P51398 398 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GFRA1P56159 465 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDN15P56746 228 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35A1P78382 337 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SYT14Q8NB59 555 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXN4Q96NZ1 517 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MARCH7Q9H992 704 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 STUB1Q9UNE7 303 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFSF11O14788 317 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAPPC6AO75865 159 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SP1P08047 785 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FMODQ06828 376 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CDONQ4KMG0 1287 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF684Q5T5D7 378 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RPTNQ6XPR3 784 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GPAT4Q86UL3 456 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 UFD1Q92890 307 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 UCN2Q96RP3 112 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 KLK13Q9UKR3 277 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 J3QLW9 94 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NME2P1O60361 137 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF19P17023 458 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 NME2P22392 152 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 UGT2B10P36537 528 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 STARP49675 285 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 BIDP55957 195 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 BDH1Q02338 343 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MFAP5Q13361 173 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TP53I3Q53FA7 332 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SMUG1Q53HV7 270 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM225Q6GV28 225 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC16A9Q7RTY1 509 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL15Q96M94 604 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJC13O75165 2243 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 A6NIZ1 184 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GFRA3O60609 400 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MT-ND5P03915 603 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GABRA5P31644 462 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RAP1BP61224 184 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 RAP1AP62834 184 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 FABP5Q01469 135 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 INSL4Q14641 139 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 CDC20BQ86Y33 519 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 UEVLDQ8IX04 471 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 HAS2Q92819 552 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PELI1Q96FA3 418 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 ADGRG7Q96K78 797 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 OXGR1Q96P68 337 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-201ENST00000284957 GLSO94925 669 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 HPNP05981 417 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SPINK2P20155 84 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ENPP1P22413 925 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CCL11P51671 97 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms