RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SYT4Q9H2B2 425 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 MMP25Q9NPA2 562 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 RAB22AQ9UL26 194 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 NTN1O95631 604 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 WNT1P04628 370 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CSN2P05814 226 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 COL9A1P20849 921 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CBX5P45973 191 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PSG6Q00889 435 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 TLE3Q04726 772 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 MEP1BQ16820 701 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 C1orf140Q5VVS0 124 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 RTL6Q6ICC9 239 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 TMUB2Q71RG4 321 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CDH26Q8IXH8 852 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PM20D2Q8IYS1 436 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PRR22Q8IZ63 422 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 OR2G2Q8NGZ5 317 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 UCK1Q9HA47 277 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 A0A0B4J203 849 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 H3BSH0 61 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 KDM4BO94953 1096 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 RAD52P43351 418 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PRKXP51817 358 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PNLIPRP2P54317 469 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CARFQ8N187 725 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 EDAQ92838 391 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 HGDQ93099 445 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CST11Q9H112 138 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 APMAPQ9HDC9 416 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 VAMP1P23763 118 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CD27P26842 260 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PUDPQ08623 228 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 MPPED2Q15777 294 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SPAG16Q8N0X2 631 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 OR6C68A6NDL8 312 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 H7C1C5 153 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 J3QRE1 110 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 IGFBP4P22692 258 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 BDKRB2P30411 391 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 LCN6P62502 163 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 RNF170Q96K19 258 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PRSS37A4D1T9 235 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 GGT3PA6NGU5 568 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 IFNA21P01568 189 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 MSX1P28360 303 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SLC26A5P58743 744 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 BTG2P78543 158 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 FUT7Q11130 342 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 BAMBIQ13145 260 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CDC20BQ86Y33 519 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 OTOSQ8NHW6 89 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PATE1Q8WXA2 126 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 DDOQ99489 341 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 GHITMQ9H3K2 345 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PPC4 97 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 THY1P04216 161 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ZNF35P13682 527 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PGAM2P15259 253 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 C17orf67Q0P5P2 114 aa8.04□□□□□ -1.12
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