RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 PTGDSP41222 190 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 CD97P48960 835 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 DAP3P51398 398 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 CCR9P51686 369 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 RPS15P62841 145 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 TRIM16LQ309B1 348 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 BTBD16Q32M84 506 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 YIF1BQ5BJH7 314 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 SLC22A10Q63ZE4 541 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF544Q6NX49 715 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 CDC20BQ86Y33 519 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 TIGD4Q8IY51 512 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 CYB561A3Q8NBI2 242 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 NEIL3Q8TAT5 605 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF519Q8TB69 540 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 C4orf36Q96KX1 117 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 SOSTQ9BQB4 213 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 HDHD5Q9BXW7 423 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 BARHL1Q9BZE3 327 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 B9D1Q9UPM9 204 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA3-201ENST00000229265 A0A1W2PNV4 684 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF879B4DU55 563 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 LRRN3E7EW58 273 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 MS4A18H0YCH9 400 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 LINC01387J3KSC0 135 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 J3QRK9 145 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 CTDSP2O14595 271 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 PDCD5O14737 125 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 GNB5O14775 395 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 ARHGEF9O43307 516 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 DNPH1O43598 174 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 SCO2O43819 266 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 TMCC2O75069 709 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 OR2J2O76002 312 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 VAMP5O95183 116 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 APOA1P02647 267 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 ITGB2P05107 769 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 COX6A1P12074 109 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 NR2C1P13056 603 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 TCN2P20062 427 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 ALOX5APP20292 161 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 MYL9P24844 172 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 DCTDP32321 178 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 PYCR1P32322 319 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 TGFBR1P36897 503 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 SSR4P51571 173 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 SCAND1P57086 179 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 OR12D2P58182 307 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 MLF1P58340 268 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 ROM1Q03395 351 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 DOC2BQ14184 412 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 CDK5R1Q15078 307 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 MS4A18Q3C1V0 323 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 ACSM3Q53FZ2 586 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 HACD4Q5VWC8 232 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 PLCZ1Q86YW0 608 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 ESX1Q8N693 406 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 OR2M3Q8NG83 312 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 GHSRQ92847 366 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM203Q969S6 136 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 TSPAN32Q96QS1 320 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 TM9SF2Q99805 663 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 SH2D2AQ9NP31 389 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 KLHL1Q9NR64 748 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 QPCTLQ9NXS2 382 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 LUZP4Q9P127 313 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 ABRACLQ9P1F3 81 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF281Q9Y2X9 895 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 SPTA1P02549 2419 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA3-201ENST00000229265 FABP12A6NFH5 140 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms