RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ATP9B-223	ENST00000590608	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM168B	A1KXE4	195 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM231B	A6NCW3	169 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ERICH4	A6NGS2	130 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ZFP92	A6NM28	416 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SIRPB1	O00241	398 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	TNFSF13	O75888	250 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SERPINA5	P05154	406 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	TFPI2	P48307	235 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	VEGFC	P49767	419 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CARD18	P57730	90 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CYTH1	Q15438	398 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	LCN12	Q6JVE5	192 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	MICU2	Q8IYU8	434 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	IQCK	Q8N0W5	287 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	C7orf33	Q8WU49	177 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	C8orf44	Q96CB5	159 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	OR2AG1	Q9H205	316 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	OR51J1	Q9H342	316 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SIAE	Q9HAT2	523 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ING4	Q9UNL4	249 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ASF1A	Q9Y294	204 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1B0GW55	424 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	PHOX2A	O14813	284 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SIVA1	O15304	175 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	MGRN1	O60291	552 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SCEL	O95171	688 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CGA	P01215	116 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ALDOB	P05062	364 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	COX7A1	P24310	79 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DLX1	P56177	255 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	TAS2R19	P59542	299 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	PRPS1	P60891	318 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB11A	P62491	216 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ECH1	Q13011	328 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	MAB21L1	Q13394	359 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ARFRP1	Q13795	201 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB11B	Q15907	218 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	UTF1	Q5T230	341 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF774	Q6NX45	483 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM54	Q969K7	222 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	UCK2	Q9BZX2	261 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	VNN3	Q9NY84	501 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	DUX4	Q9UBX2	424 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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