RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578528.1

RPL17-201, Transcript of ribosomal protein L17, humanhuman

TSL 3

Gene RPL17, Length 481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17-201ENST00000578528 NPRL3Q12980 569 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 CAMK2DQ13557 499 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 GINS1Q14691 196 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 HIST3H3Q16695 136 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 LRRC36Q1X8D7 754 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 PGGHGQ32M88 737 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 MESTQ5EB52 335 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 TSPO2Q5TGU0 170 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 FBXW9Q5XUX1 488 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ADCK1Q86TW2 530 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ZNF610Q8N9Z0 462 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 NRG4Q8WWG1 115 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 TMEM54Q969K7 222 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ZNF566Q969W8 418 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 KCNK17Q96T54 332 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ALG12Q9BV10 488 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 SLC7A10Q9NS82 523 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 PRSS50Q9UI38 385 aa20.64■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ZAR1LA6NP61 321 aa20.63■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 E9PQ18 207 aa20.63■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 AHCYL1O43865 530 aa20.63■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.891e-323■■■■□ 23.1
RPL17-201ENST00000578528 POU1F1P28069 291 aa20.63■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa20.63■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 NOXO1Q8NFA2 376 aa20.63■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 RASD2Q96D21 266 aa20.63■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 SNX18Q96RF0 628 aa20.63■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 DLGAP1O14490 977 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 UPK3AO75631 287 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 EPHA2P29317 976 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 CSNK1A1P48729 337 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 PCYT1AP49585 367 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 MYBPC1Q00872 1141 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ACSM5Q6NUN0 579 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 Q6ZT83 130 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 BEND4Q6ZU67 534 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 GABRG1Q8N1C3 465 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 IQCF1Q8N6M8 205 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 FNDC8Q8TC99 324 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 GLTPQ9NZD2 209 aa20.62■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 XKRYO14609 159 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ARHGEF9O43307 516 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 NR2C1P13056 603 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 NOS3P29474 1203 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ASCL1P50553 236 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 CDSNQ15517 529 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 STK11Q15831 433 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 PHYHD1Q5SRE7 291 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 SLX4IPQ5VYV7 408 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 CARD17Q5XLA6 110 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 GALNT4Q8N4A0 578 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 FAM26EQ8N5C1 309 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 MBOAT4Q96T53 435 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 GRIP2Q9C0E4 1043 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 TOR3AQ9H497 397 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 PRSS37A4D1T9 235 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 AGFG2O95081 481 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 CLDN14O95500 239 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 HMGN1P05114 100 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 CLRN1P58418 232 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 LGALS3BPQ08380 585 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 LINGO2Q7L985 606 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 GPR137CQ8N3F9 429 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 DDOQ99489 341 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 CMC2Q9NRP2 79 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ASB6Q9NWX5 421 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 ELOVL5Q9NYP7 299 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 UPB1Q9UBR1 384 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 KLHL21Q9UJP4 597 aa20.6■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 SLC22A23A1A5C7 686 aa20.59■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 SNAP29O95721 258 aa20.59■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 IGHV3-9P01782 118 aa20.59■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 COX5AP20674 150 aa20.59■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
RPL17-201ENST00000578528 P2RY6Q15077 328 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms