RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 NUDT15Q9NV35 164 aa2.33□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa2.33□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa2.33□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa2.33□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 DCHS1Q96JQ0 3298 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 GSAPA4D1B5 854 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 RS1O15537 224 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 MBTPS2O43462 519 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SEC22BO75396 215 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 LRATO95237 230 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM16O95361 564 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 IGKV1-17P01599 117 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CCL5P13501 91 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CYP2F1P24903 491 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ADORA1P30542 326 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 AP3M2P53677 418 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TCP10Q12799 353 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 RIPK1Q13546 671 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 GPRC6AQ5T6X5 926 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CTRB2Q6GPI1 263 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PAQR7Q86WK9 346 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ERO1BQ86YB8 467 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 DTX3LQ8TDB6 740 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 GPR61Q9BZJ8 451 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CLMPQ9H6B4 373 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 WDR76Q9H967 626 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SIAEQ9HAT2 523 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 LHX9Q9NQ69 397 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 GNG12Q9UBI6 72 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 STAP1Q9ULZ2 295 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CACNA1HO95180 2353 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 KIF16BQ96L93 1317 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PLXNA3P51805 1871 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 LRP4O75096 1905 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 FANCMQ8IYD8 2048 aa2.32□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 USP34Q70CQ2 3546 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 COL4A6Q14031 1691 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 C2orf16Q68DN1 1984 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 DOCK6Q96HP0 2047 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PPIAL4EA0A075B759 164 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PPIAL4DF5H284 164 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CCER2I3L3R5 266 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 DCTN6O00399 190 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CTAGE5O15320 804 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CHADO15335 359 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TPST2O60704 377 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 STAMBPO95630 424 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF286BP0CG31 522 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PPIAL4FP0DN26 164 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 GAP43P17677 238 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SLC26A3P40879 764 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 GLP1RP43220 463 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 KIR2DS4P43632 304 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CAMLGP49069 296 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PLA2G16P53816 162 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 DLX1P56177 255 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 HSD17B7P56937 341 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 GRB7Q14451 532 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ATP6AP1Q15904 470 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 FAM83EQ2M2I3 478 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 FKBP1CQ5VVH2 108 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 FRMPD2BQ6IN97 320 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 IGFL1Q6UW32 110 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 Q6ZN92 141 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 DHRSXQ8N5I4 330 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 STXBP6Q8NFX7 210 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 OR10A7Q8NGE5 316 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 FCRL1Q96LA6 429 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 KRT23Q9C075 422 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 C20orf85Q9H1P6 137 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 HSD3B7Q9H2F3 369 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CCL28Q9NRJ3 127 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TECTAO75443 2155 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 MROH5Q6ZUA9 1318 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 DENND4AQ7Z401 1863 aa2.31□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 MYO15AQ9UKN7 3530 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 DMXL1Q9Y485 3027 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TRDCB7Z8K6 153 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 LGALS2P05162 132 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 RETP07949 1114 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 H2BFMP0C1H6 154 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 CCND2P30279 289 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 LRRC26Q2I0M4 334 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 BCL7AQ4VC05 210 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 TP53I3Q53FA7 332 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 LRRC10Q5BKY1 277 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 KCNIP4Q6PIL6 250 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF620Q6ZNG0 422 aa2.3□□□□□ -2.04
CPEB4-210ENST00000522344 PRSS41Q7RTY9 318 aa2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms