RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL26Q9NPH9 171 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C8orf17Q9NRJ1 99 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C21orf62Q9NYP8 219 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CALYQ9NYX4 217 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 P2RX2Q9UBL9 471 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DNAJB9Q9UBS3 223 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FOXJ3Q9UPW0 622 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MYOFQ9NZM1 2061 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 E9PMD0 336 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCER2I3L3R5 266 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SGK494L7N484 410 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UGT2B17O75795 530 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGF1P05019 195 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CT62P0C5K7 136 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AREGP15514 252 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAICSP22234 425 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DTYMKP23919 212 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CD1CP29017 333 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AQP2P41181 271 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DAP3P51398 398 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL5RAQ01344 420 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAB21L1Q13394 359 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FUT11Q495W5 492 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TEX30Q5JUR7 227 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MED27Q6P2C8 311 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 H2AFVQ71UI9 128 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TPRA1Q86W33 373 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 METTL23Q86XA0 190 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC191Q8NCU4 936 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TTLQ8NG68 377 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR5D13Q8NGL4 314 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CFAP36Q96G28 342 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GBP5Q96PP8 586 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RBBP8Q99708 897 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF286AQ9HBT8 521 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 POPDC2Q9HBU9 364 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KCNIP1Q9NZI2 227 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CNIH4Q9P003 139 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIAA1257Q9ULG3 409 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SNX5Q9Y5X3 404 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CACNA1EQ15878 2313 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LCTP09848 1927 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC7Q96M83 1385 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF222A6NCQ9 220 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C15orf65H3BRN8 121 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HIP1O00291 1037 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NDUFA7O95182 113 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CXCL14O95715 111 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IFNAR1P17181 557 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PSMB5P28074 263 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CEACAM6P40199 344 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EPS15P42566 896 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SCN1BQ07699 218 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AP1B1Q10567 949 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BIKQ13323 160 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CARTPTQ16568 116 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CFAP161Q6P656 301 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CNIH2Q6PI25 160 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARL9Q6T311 187 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLET1Q6UQ28 207 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KCTD9Q7L273 389 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EFCAB13Q8IY85 973 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VN1R2Q8NFZ6 395 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC114Q96M63 670 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC6A7Q99884 636 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM213AQ9BRX8 229 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SIRPDQ9H106 197 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C1orf198Q9H425 327 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SMYD3Q9H7B4 428 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CTSFQ9UBX1 484 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BCAP29Q9UHQ4 241 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAD2L2Q9UI95 211 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SHANK3Q9BYB0 1731 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DENND4AQ7Z401 1863 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms