RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516411.1

RNU6-977P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 977, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-977P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-977P-201ENST00000516411 TMEM223A0PJW6 202 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 C7orf66A4D0T2 115 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF233A6NK53 670 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF726A6NNF4 738 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF850A8MQ14 1090 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 A8MUI8 341 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 BPY2O14599 106 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRRG1O14668 218 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 SOCS1O15524 211 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 SCGNO76038 276 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 YIF1AO95070 293 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 DIRAS3O95661 229 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ALDOBP05062 364 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 IGKV4-1P06312 121 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 IGKV1-13P0DP09 117 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 FOLR1P15328 257 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 NPY1RP25929 384 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 AK4P27144 223 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCR1P32246 355 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ATP6V1E1P36543 226 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 KIR3DL2P43630 455 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 QARSP47897 775 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 RGS4P49798 205 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCR8P51685 355 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 KRTAP12-3P60328 96 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 RPS21P63220 83 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC7A9P82251 487 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 CBX1P83916 185 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ACVR1Q04771 509 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 KLHL30Q0D2K2 578 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ERCC8Q13216 396 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 AQP6Q13520 282 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 PON3Q15166 354 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 POU2AF1Q16633 256 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 KLHL38Q2WGJ6 581 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC36A3Q495N2 470 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF684Q5T5D7 378 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 RAET1LQ5VY80 246 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 TTC23Q5W5X9 447 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 LCN12Q6JVE5 192 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF493Q6ZR52 646 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 TMEM179Q6ZVK1 233 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 PGAP1Q75T13 922 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 HDDC2Q7Z4H3 204 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRIM69Q86WT6 500 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 CALHM3Q86XJ0 350 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 NUDCD3Q8IVD9 361 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF547Q8IVP9 402 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC35F2Q8IXU6 374 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC38A6Q8IZM9 456 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 MREGQ8N565 214 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 LINC00304Q8N9R0 145 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 IPMKQ8NFU5 416 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 OR52H1Q8NGJ2 320 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 OR5D13Q8NGL4 314 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 OR4S2Q8NH73 311 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCDC110Q8TBZ0 833 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 PYROXD1Q8WU10 500 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ABHD3Q8WU67 409 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 CREB3L1Q96BA8 519 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 DNAJC19Q96DA6 116 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 PDXPQ96GD0 296 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZNF681Q96N22 645 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 DOK1Q99704 481 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 RNF5Q99942 180 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 SH3GL1Q99961 368 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 NAT9Q9BTE0 207 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 EDEM2Q9BV94 578 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 TEKT3Q9BXF9 490 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 GABARAPL3Q9BY60 117 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 ACTR6Q9GZN1 396 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 UGT1A7Q9HAW7 530 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 UGT1A10Q9HAW8 530 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 UGT1A8Q9HAW9 530 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 C12orf10Q9HB07 376 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 WFDC1Q9HC57 220 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-977P-201ENST00000516411 RNF14Q9UBS8 474 aa0.36□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms