RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	C16orf87	Q6PH81	154 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	KLB	Q86Z14	1044 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508		Q96M85	177 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	NMNAT3	Q96T66	252 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TIMP4	Q99727	224 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	PROK2	Q9HC23	129 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ASB6	Q9NWX5	421 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	OR6C68	A6NDL8	312 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508		J3QRK9	145 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TP53I11	O14683	189 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	AHSA1	O95433	338 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	PLA2G2A	P14555	144 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	PRKCA	P17252	672 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SPI1	P17947	270 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CNR1	P21554	472 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	IDUA	P35475	653 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF85	Q03923	595 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	INA	Q16352	499 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	LEG1	Q6P5S2	330 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MIB2	Q96AX9	1013 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TBX5	Q99593	518 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A075B6Q4	140 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM166B	A8MTA8	275 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	GLCE	O94923	617 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	WISP1	O95388	367 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	OR2T7	P0C7T2	308 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	GAA	P10253	952 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	PTGDS	P41222	190 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CASP3	P42574	277 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SGCB	Q16585	318 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	OR2T27	Q8NH04	317 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	OR5J2	Q8NH18	312 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM203	Q969S6	136 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	KCTD7	Q96MP8	289 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MED18	Q9BUE0	208 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1B0GVG6	124 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNHIT1	O43257	154 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	OR2T1	O43869	369 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	IL1A	P01583	271 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	HLA-DPB1	P04440	258 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	F13B	P05160	661 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF24	P17028	368 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CD53	P19397	219 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	CEL	P19835	753 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	GAL	P22466	123 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TAS2R43	P59537	309 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	FABP5	Q01469	135 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	PLGLB1	Q02325	96 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	C22orf42	Q6IC83	251 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	NUAK2	Q9H093	628 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TMEM18-208	ENST00000497508	MED11	Q9P086	117 aa		13.1	□□□□□ -0.31

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