RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 AMELYQ99218 206 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 KCNJ15Q99712 375 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PRRX2Q99811 253 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TTYH2Q9BSA4 534 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 SSX4O60224 188 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 HLA-DOBP13765 273 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF19P17023 458 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ITPKBP27987 946 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 MED11Q9P086 117 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 B9D1Q9UPM9 204 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CACNA1CQ13936 2221 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa5.06□□□□□ -1.6
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