RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP3K8P41279 467 aa3.91□□□□□ -1.78
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RPS3AP54-201ENST00000435535 IL12AP29459 219 aa3.9□□□□□ -1.79
RPS3AP54-201ENST00000435535 S100A3P33764 101 aa3.9□□□□□ -1.79
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RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR12P47775 334 aa3.9□□□□□ -1.79
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