RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371974.7

SURF1-201, Transcript of SURF1, cytochrome c oxidase assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SURF1, Length 1,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1-201ENST00000371974 NPIPB4C9JG80 1138 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 GADD45GO95257 159 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 STAMBPO95630 424 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 PGA4P0DJD7 388 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 PGA3P0DJD8 388 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 ATP6V1B2P21281 511 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 GPR4P46093 362 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 SLC22A25Q6T423 547 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 ZNF813Q6ZN06 617 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 OR52J3Q8NH60 311 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 THTPAQ9BU02 230 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 CXXC4Q9H2H0 198 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 TXNIPQ9H3M7 391 aa22.14■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 CADP27708 2225 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 TRAV27A0A087WT01 109 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 SHISA9B4DS77 424 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 GYG2O15488 501 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 ACADSP16219 412 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 SPIBQ01892 262 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 DNAL1Q4LDG9 190 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 LCN8Q6JVE9 175 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 ZNF627Q7L945 461 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 OR13C2Q8NGS9 318 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 NEUROG1Q92886 237 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 ASB9Q96DX5 294 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 SEPHS2Q99611 448 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 FOXB1Q99853 325 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 POU2F3Q9UKI9 436 aa22.13■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 SMPD2O60906 423 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 SEC14L2O76054 403 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 CAPZA2P47755 286 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 CDH11P55287 796 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 CTXN1P60606 82 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 TUBA1BP68363 451 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 TUBA4AP68366 448 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 MS4A2Q01362 244 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 LRFN4Q6PJG9 635 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 SPNS3Q6ZMD2 512 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 TUBA1AQ71U36 451 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 FAM169BQ8N8A8 192 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 OR4K5Q8NGD3 323 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 TMEM171Q8WVE6 324 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 LRGUKQ96M69 825 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 SLC38A2Q96QD8 506 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 NDEL1Q9GZM8 345 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 AURKCQ9UQB9 309 aa22.12■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 CDC42EP2O14613 210 aa22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 TMCC2O75069 709 aa22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 ENTPD5O75356 428 aa22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 TRMUO75648 421 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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SURF1-201ENST00000371974 FHL1Q13642 323 aa22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 C3orf36Q3SXR2 165 aa22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 ZBED5Q49AG3 693 aa22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 ARMC4Q5T2S8 1044 aa22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 SYT14Q8NB59 555 aa22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 NOXO1Q8NFA2 376 aa22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 CLPTM1LQ96KA5 538 aa22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 MAGIXQ9H6Y5 334 aa22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 TCRBV5S2A0A599 114 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 SH3PXD2BA1X283 911 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 DHHO43323 396 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 DSCAMO60469 2012 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 NR2C1P13056 603 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 CBR1P16152 277 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 RRM2P31350 389 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 RPL4P36578 427 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 OMPP47874 163 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 RPL27P61353 136 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 RUNX1T1Q06455 604 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 SPOCK1Q08629 439 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 SEC23BQ15437 767 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 HIST3H3Q16695 136 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 LRRC75AQ8NAA5 344 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 MCHR2Q969V1 340 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 KCNS3Q9BQ31 491 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 FUZQ9BT04 418 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 CXorf56Q9H5V9 222 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 FAIMQ9NVQ4 179 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 TMCC3Q9ULS5 477 aa22.1■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa22.09■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 KRT36O76013 467 aa22.09■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 IGHMP01871 453 aa22.09■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 B4GALT1P15291 398 aa22.09■■□□□ 1.13
SURF1-201ENST00000371974 ARR3P36575 388 aa22.09■■□□□ 1.13
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