RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 ARMC4Q5T2S8 1044 aa23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 FBXW5Q969U6 566 aa23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF347Q96SE7 839 aa23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 MCIDASD6RGH6 385 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 TRMUO75648 421 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 FABP3P05413 133 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 CELA3BP08861 270 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 LIMS1P48059 325 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 SPIBQ01892 262 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 PGGHGQ32M88 737 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 SLC22A25Q6T423 547 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 SPNS3Q6ZMD2 512 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF813Q6ZN06 617 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 OAFQ86UD1 273 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP24Q8N264 748 aa23.52■■□□□ 1.36
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TPGS1-201ENST00000359315 OR4K5Q8NGD3 323 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 SEPHS2Q99611 448 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 FOXB1Q99853 325 aa23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf21Q9H246 121 aa23.52■■□□□ 1.36
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TPGS1-201ENST00000359315 HTR3EA5X5Y0 456 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 E7EQL1 145 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 IGHG1P01857 330 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 DANCRP0C864 163 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 OMPP47874 163 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 DAP3P51398 398 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 LCN8Q6JVE9 175 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF627Q7L945 461 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 SYT14Q8NB59 555 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 GPA33Q99795 319 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 THTPAQ9BU02 230 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 IL1RAPQ9NPH3 570 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF224Q9NZL3 707 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 LAMP3Q9UQV4 416 aa23.51■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 ALPK2Q86TB3 2170 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 HLA-HP01893 362 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 QDPRP09417 244 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 ACADSP16219 412 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 ITGA2P17301 1181 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 CLRN1P58418 232 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 CTXN1P60606 82 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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TPGS1-201ENST00000359315 MDP1Q86V88 176 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 CLDN22Q8N7P3 220 aa23.5■■□□□ 1.35
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TPGS1-201ENST00000359315 MCHR2Q969V1 340 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 SLC38A2Q96QD8 506 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 TSPAN32Q96QS1 320 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 TXNIPQ9H3M7 391 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 MOKQ9UQ07 419 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 MGAT4BQ9UQ53 548 aa23.5■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 ROS1P08922 2347 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 DHHO43323 396 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 GADD45GO95257 159 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 IGLV1-44P01699 117 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 IGHMP01871 453 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 CECR9P0C854 216 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 RRM2P31350 389 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 CAPZA2P47755 286 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 FMODQ06828 376 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 RRM2BQ7LG56 351 aa23.49■■□□□ 1.35
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TPGS1-201ENST00000359315 FGFBP3Q8TAT2 258 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 PERPQ96FX8 193 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 POU2F3Q9UKI9 436 aa23.49■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 SH3PXD2BA1X283 911 aa23.48■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 NPIPB13A6NJU9 1138 aa23.48■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 NPIPB4C9JG80 1138 aa23.48■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 SMPD2O60906 423 aa23.48■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 SLC2A10O95528 541 aa23.48■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 IGKV3-15P01624 115 aa23.48■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 SLC9A3P48764 834 aa23.48■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 CDK20Q8IZL9 346 aa23.48■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 WFDC11Q8NEX6 87 aa23.48■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 RADILQ96JH8 1075 aa23.48■■□□□ 1.35
TPGS1-201ENST00000359315 MUC13Q9H3R2 512 aa23.48■■□□□ 1.35
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