RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 OR6N1Q8NGY5 312 aa19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ZNF566Q969W8 418 aa19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 LRGUKQ96M69 825 aa19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa19.49■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 MCIDASD6RGH6 385 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 KRT36O76013 467 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 RAP2AP10114 183 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ACADSP16219 412 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 CTXN1P60606 82 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 BSPH1Q075Z2 132 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 THSD4Q6ZMP0 1018 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN32Q96QS1 320 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 CHID1Q9BWS9 393 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ULBP2Q9BZM5 246 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 LRMDAQ9H2I8 198 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 NGBQ9NPG2 151 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 AMDHD2Q9Y303 409 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 OTOGQ6ZRI0 2925 aa19.48■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 CREBBPQ92793 2442 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 MYO9AB2RTY4 2548 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 SEC14L2O76054 403 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 RASSF2P50749 326 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 DAP3P51398 398 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ZNF83P51522 516 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 PRPS1P60891 318 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 RPL27P61353 136 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 FLOT2Q14254 428 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 C1orf94Q6P1W5 598 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ASRGL1Q7L266 308 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 CDH24Q86UP0 819 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ZNF519Q8TB69 540 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 KCNK17Q96T54 332 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 TRIM15Q9C019 465 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa19.47■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 CENPBD1B2RD01 187 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF11BO00300 401 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 IGHG1P01857 330 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 QDPRP09417 244 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 GSSP48637 474 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 TUBA1BP68363 451 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 TUBA4AP68366 448 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 TAF11Q15544 211 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 OR2T5Q6IEZ7 315 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 PGBD2Q6P3X8 592 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 TUBA1AQ71U36 451 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 FAM122BQ7Z309 247 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 SYT14Q8NB59 555 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 OR2T29Q8NH02 315 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 MCHR2Q969V1 340 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 SLCO4A1Q96BD0 722 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 OBP2BQ9NPH6 170 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 ZNF224Q9NZL3 707 aa19.46■□□□□ 0.71
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 DHRS12A0PJE2 317 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 UNC119BA6NIH7 251 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 DHHO43323 396 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 OR10H3O60404 316 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 CD40P25942 277 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 ERVK-25P63136 954 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 MYBPC1Q00872 1141 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 ADAM5Q6NVV9 412 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 PAMR1Q6UXH9 720 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 CLDN22Q8N7P3 220 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 NOXO1Q8NFA2 376 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 NEUROG1Q92886 237 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 FOXB1Q99853 325 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 KATNB1Q9BVA0 655 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 NRIP3Q9NQ35 241 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 B3GNT2Q9NY97 397 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 TMCC3Q9ULS5 477 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 AURKCQ9UQB9 309 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa19.45■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 SHISA9B4DS77 424 aa19.44■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 ATE1O95260 518 aa19.44■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 STAMBPO95630 424 aa19.44■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 CD3EP07766 207 aa19.44■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 CD14P08571 375 aa19.44■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 FPR3P25089 353 aa19.44■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 ACVR1BP36896 505 aa19.44■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 CLRN1P58418 232 aa19.44■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 CBX1P83916 185 aa19.44■□□□□ 0.7
SYF2-201ENST00000236273 SPOCK1Q08629 439 aa19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.2 ms