RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GWJ7 208 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM72A0PK05 275 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 H0YIV9 168 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 LEFTY2O00292 366 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 PHYHO14832 338 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ABLIM3O94929 683 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 GRPRP30550 384 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 RBP2P50120 134 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SPCS3P61009 180 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TFF2Q03403 129 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 IL10RAQ13651 578 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TPGS2Q68CL5 300 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 OR10K2Q6IF99 312 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF607Q96SK3 696 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TEX12Q9BXU0 123 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 RHOFQ9HBH0 211 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 CAPN10Q9HC96 672 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 POLE3Q9NRF9 147 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD10Q9NXR5 420 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 COMMD9Q9P000 198 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PPE2 198 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 GLOD5A6NK44 160 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 PPM1DO15297 605 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 GRM6O15303 877 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R3DO95685 299 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV2-5P01817 119 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SOD2P04179 222 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 CD3DP04234 171 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ADH1AP07327 375 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 FBXO45P0C2W1 286 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ELFN1P0C7U0 828 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 GKN3PP0CG01 181 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 CASRP41180 1078 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TM4SF4P48230 202 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TAS2R20P59543 309 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TRAM1Q15629 374 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZNB5 142 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ADCK2Q7Z695 626 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 VRK2Q86Y07 508 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 OR1J2Q8NGS2 313 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 GPR148Q8TDV2 347 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF480Q8WV37 535 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 RAB3CQ96E17 227 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 LYSMD1Q96S90 227 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRT-211ENST00000618610 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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PTPRT-211ENST00000618610 CA14Q9ULX7 337 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 KCNE3Q9Y6H6 103 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0D9SG52 128 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GV50 99 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 MBTPS2O43462 519 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 UGDHO60701 494 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ASGR2P07307 311 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 PGAM2P15259 253 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 AGAP20933 346 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 UQCRC2P22695 453 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ACSM1Q08AH1 577 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 RSU1Q15404 277 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFA9Q16795 377 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ACTBL2Q562R1 376 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM215Q68D42 235 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 KCTD9Q7L273 389 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 PXKQ7Z7A4 578 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF558Q96NG5 402 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 SEC11CQ9BY50 192 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRT-211ENST00000618610 OR2AG1Q9H205 316 aa7.5□□□□□ -1.21
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