RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF19P17023 458 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 UQCRC1P31930 480 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TGM4P49221 684 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 BAK1Q16611 211 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf189Q5VU69 101 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 MISPQ8IVT2 679 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PGLYRP3Q96LB9 341 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TBX5Q99593 518 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 WWTR1Q9GZV5 400 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 NANSQ9NR45 359 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ONECUT2O95948 504 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAPPC2P0DI81 140 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAPPC2BP0DI82 140 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SPI1P17947 270 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PGCP20142 388 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 DCDP81605 110 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 NSDHLQ15738 373 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 FCRLBQ6BAA4 426 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL9Q6T311 187 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 C5orf46Q6UWT4 87 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM122BQ7Z309 247 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF321PQ8N8H1 164 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 IL17RDQ8NFM7 739 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 FDCSPQ8NFU4 85 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS4Y2Q8TD47 263 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SMIM19Q96E16 107 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX18Q96RF0 628 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 NBASA2RRP1 2371 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PQ09 198 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CYC1P08574 325 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CSF3P09919 207 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CLUP10909 449 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SPNP16150 400 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SDHAP31040 664 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SSPNQ14714 243 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK5R1Q15078 307 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC17Q8N6Y2 441 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 LMF1Q96S06 567 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A11Q9NSA0 550 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 COMMD3Q9UBI1 195 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 COL12A1Q99715 3063 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 FER1L5A0AVI2 2057 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SHISA3A0PJX4 238 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRTM2O43300 516 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL6IP5O75915 188 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 MT-ATP6P00846 226 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TFP02787 698 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 OR12D2P58182 307 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 AGAP6Q5VW22 663 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC6A19Q695T7 634 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 CNIH2Q6PI25 160 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 APOOLQ6UXV4 268 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 AKAP14Q86UN6 197 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 C9orf40Q8IXQ3 194 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 AGAP4Q96P64 663 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ADOQ96SZ5 270 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 VN1R1Q9GZP7 353 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXL4Q9UKA2 621 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 RABL2BQ9UNT1 228 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPB2A8KAH6 182 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 OIP5O43482 229 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PLCXD2Q0VAA5 305 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPB2Q16082 182 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PYDC2Q56P42 97 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ALG10Q5BKT4 473 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF544Q6NX49 715 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 JAZF1Q86VZ6 243 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB43Q86YS6 212 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6S1Q8NH40 331 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF563Q8TA94 476 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 ARSGQ96EG1 525 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TIGARQ9NQ88 270 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-204ENST00000587718 A8MUA0 341 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 E9PI62 339 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 GNB5O14775 395 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ICOSLGO75144 302 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CD63P08962 238 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 PYCR1P32322 319 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 CENPAP49450 140 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 RRADP55042 308 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SIRPAP78324 504 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 EFR3AQ14156 821 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ZMAT1Q5H9K5 638 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-204ENST00000587718 HACD4Q5VWC8 232 aa22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms