RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 HRH3Q9Y5N1 445 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SCRG1O75711 98 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 APEHP13798 732 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SLC36A2Q495M3 483 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SLC48A1Q6P1K1 146 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 C5orf46Q6UWT4 87 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00346Q8IVM7 164 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 OR5D18Q8NGL1 313 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf72A6NCS6 295 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 AP1G1O43747 822 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 CNR1P21554 472 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 CST5P28325 142 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 HOXC8P31273 242 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 CST9LP1Q5W188 147 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SLC7A6Q92536 515 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2FQ969M7 185 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SLC23A2Q9UGH3 650 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 HCRTR1O43613 425 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 CD63P08962 238 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 BIDP55957 195 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 IKZF1Q13422 519 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 STEAP1BQ6NZ63 245 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 CMIPQ8IY22 773 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 HPSE2Q8WWQ2 592 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SLC22A12Q96S37 553 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 FKRPQ9H9S5 495 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 M0QYG6 137 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 APOA2P02652 100 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 F11P03951 625 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 MISPQ8IVT2 679 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 NUP98P52948 1817 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 CITO14578 2027 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 PMP2P02689 132 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SMIM18P0DKX4 95 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 GPX2P18283 190 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SEMA3BQ13214 749 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 RABEPKQ7Z6M1 372 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 KCNG3Q8TAE7 436 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 HDAC8Q9BY41 377 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 ASIC5Q9NY37 505 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 SELENOFO60613 162 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 KLKB1P03952 638 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 UPRTQ96BW1 309 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 VPS25Q9BRG1 176 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRM-211ENST00000580170 PRAMEF20Q5VT98 475 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZTK2 550 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 OR52N1Q8NH53 320 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 NPPBP16860 134 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 PFN4Q8NHR9 129 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 LTC4SQ16873 150 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 PLPP5Q8NEB5 264 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 OR10Z1Q8NGY1 313 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 MARCH5Q9NX47 278 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 MCRIP1C9JLW8 97 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 CXCL12P48061 93 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 ACSM1Q08AH1 577 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 PDZK1IP1Q13113 114 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 RASD2Q96D21 266 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 ULBP3Q9BZM4 244 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 ADAM19Q9H013 955 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 CHST8Q9H2A9 424 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 SRMP19623 302 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 KITLGP21583 273 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 XKR7Q5GH72 579 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 DLEU7Q6UYE1 221 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 SLC22A24Q8N4F4 322 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 NUDT8Q8WV74 236 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 PPT2Q9UMR5 302 aa19.7■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 CLN5O75503 358 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 TRAPPC2P0DI81 140 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 TRAPPC2BP0DI82 140 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 CSNK1G2P78368 415 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 SLC35A1P78382 337 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 BRICD5Q6PL45 260 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 TXN2Q99757 166 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 TM7SF3Q9NS93 570 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 RGPD1P0DJD0 1748 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 HBE1P02100 147 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 NAGAP17050 411 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM31Q5JXX7 168 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM64Q6YI46 380 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 MBOAT4Q96T53 435 aa19.69■□□□□ 0.74
PTPRM-211ENST00000580170 SOCS7O14512 581 aa19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms