RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566600.1

NME3-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 913 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-209ENST00000566600 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa23■■□□□ 1.27
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NME3-209ENST00000566600 C20orf196Q8IYI0 205 aa23■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 OR13C2Q8NGS9 318 aa23■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 OR6N1Q8NGY5 312 aa23■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 MUS81Q96NY9 551 aa23■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 TRAV27A0A087WT01 109 aa22.99■■□□□ 1.27
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NME3-209ENST00000566600 GABRA6Q16445 453 aa22.99■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 CARD17Q5XLA6 110 aa22.99■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 C17orf78Q8N4C9 275 aa22.99■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 ZNF566Q969W8 418 aa22.99■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 MUCL1Q96DR8 90 aa22.99■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 GPR35Q9HC97 309 aa22.99■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 NGBQ9NPG2 151 aa22.99■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 DCHS2Q6V1P9 2916 aa22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 OR5H1A6NKK0 313 aa22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 CENPBD1B2RD01 187 aa22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 CST1P01037 141 aa22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 THBDP07204 575 aa22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 CSNK1A1P48729 337 aa22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 FHL1Q13642 323 aa22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 STK11Q15831 433 aa22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 ACKR1Q16570 336 aa22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 C9orf135Q5VTT2 229 aa22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 C22orf34Q6ZV56 151 aa22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 BOD1Q96IK1 185 aa22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 TXNIPQ9H3M7 391 aa22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 FAM221AA4D161 298 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 UNC119BA6NIH7 251 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 M0R3G1 203 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 KLF4O43474 513 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 IGHG1P01857 330 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 PRF1P14222 555 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 FPR3P25089 353 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 HOXC12P31275 282 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 CTXN1P60606 82 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 MELKQ14680 651 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 TAB1Q15750 504 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 FAM205BPQ63HN1 556 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 ZER1Q7Z7L7 766 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 WFDC8Q8IUA0 241 aa22.97■■□□□ 1.27
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NME3-209ENST00000566600 CRLF2Q9HC73 371 aa22.97■■□□□ 1.27
NME3-209ENST00000566600 SIGLEC7Q9Y286 467 aa22.97■■□□□ 1.27
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NME3-209ENST00000566600 FKBP6O75344 327 aa22.96■■□□□ 1.27
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NME3-209ENST00000566600 C1orf94Q6P1W5 598 aa22.96■■□□□ 1.27
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NME3-209ENST00000566600 TMEM54Q969K7 222 aa22.96■■□□□ 1.27
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NME3-209ENST00000566600 RASSF1Q9NS23 344 aa22.96■■□□□ 1.27
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NME3-209ENST00000566600 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 CLRN1P58418 232 aa22.95■■□□□ 1.26
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NME3-209ENST00000566600 ARMC4Q5T2S8 1044 aa22.95■■□□□ 1.26
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NME3-209ENST00000566600 AMDHD2Q9Y303 409 aa22.95■■□□□ 1.26
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NME3-209ENST00000566600 A6NIZ1 184 aa22.94■■□□□ 1.26
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NME3-209ENST00000566600 GSSP48637 474 aa22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 RAP1BP61224 184 aa22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 RAP1AP62834 184 aa22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 TSPAN31Q12999 210 aa22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 MICAQ29983 383 aa22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 PHYHD1Q5SRE7 291 aa22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 PGBD2Q6P3X8 592 aa22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 ANKRD16Q6P6B7 361 aa22.94■■□□□ 1.26
NME3-209ENST00000566600 KLHL24Q6TFL4 600 aa22.94■■□□□ 1.26
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