RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 DUSP13Q9UII6 198 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 CORINQ9Y5Q5 1042 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 A0A087WUJ7 227 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PPW3 197 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 TFP02787 698 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 NAT2P11245 290 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 PRKAR1BP31321 381 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 GIPRP48546 466 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 TMEM33P57088 247 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 PMS2P3Q13401 168 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 CAMK2DQ13557 499 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 WDR93Q6P2C0 686 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 ULK3Q6PHR2 472 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 MIER2Q8N344 545 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 OR51F2Q8NH61 342 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 YIPF5Q969M3 257 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 EPYCQ99645 322 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 FOXB1Q99853 325 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CS-214ENST00000548849 WNT9BO14905 357 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 UBDO15205 165 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 SERPINI2O75830 405 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 UBL3O95164 117 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 GAAP10253 952 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 ETS2P15036 469 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 AHCYP23526 432 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 LSP1P33241 339 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 NCALDP61601 193 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 FADDQ13158 208 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 RAB39AQ14964 217 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 FXNQ16595 210 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 ZNF627Q7L945 461 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 SCAIQ8N9R8 606 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 OR6S1Q8NH40 331 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 GTF2H4Q92759 462 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 SLC41A3Q96GZ6 507 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 DYSFO75923 2080 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 TPST1O60507 370 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 BGLAPP02818 100 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 PATE4P0C8F1 98 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 BMP2P12643 396 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 PUDPQ08623 228 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 COMTD1Q86VU5 262 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 C3orf56Q8N813 242 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 OR52B2Q96RD2 323 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 SLC7A8Q9UHI5 535 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 LRRN3E7EW58 273 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 WIPF1O43516 503 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 NCR1O76036 304 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 CSNK1A1P48729 337 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 LMO4P61968 165 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 MYBPC1Q00872 1141 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 OR1Q1Q15612 314 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 NHLRC1Q6VVB1 395 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 KRT73Q86Y46 540 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 ZNF385DQ9H6B1 395 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 C11orf98E9PRG8 122 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-214ENST00000548849 TRIM77I1YAP6 450 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms