RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 LAP3P28838 519 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RAB28P51157 221 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 UBA52P62987 128 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 NHLH1Q02575 133 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 NCMAPQ5T1S8 102 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 AADACL4Q5VUY2 407 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 METRNLQ641Q3 311 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RAB12Q6IQ22 244 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf88Q6PI97 169 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PGAP1Q75T13 922 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM99Q8N816 258 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ABHD4Q8TB40 342 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A38Q96DW6 304 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM19Q96HH6 336 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM68Q96MH6 324 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CLCC1Q96S66 551 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SPACA6W5XKT8 324 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 KCNAB3O43448 404 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TNFSF14O43557 240 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 EPXP11678 715 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ABOP16442 354 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 NBL1P41271 181 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 UQCC3Q6UW78 93 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 VRK3Q8IV63 474 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR5W2Q8NH69 310 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR4C6Q8NH72 309 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SNX33Q8WV41 574 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PATE1Q8WXA2 126 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 UCK1Q9HA47 277 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TREM2Q9NZC2 230 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 IRGMA1A4Y4 181 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 URADA6NGE7 173 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD61A6NGH8 418 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SFTPCP11686 197 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GLB1P16278 677 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC6A12P48065 614 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 C21orf58P58505 322 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GMFBP60983 142 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RPS15P62841 145 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PON3Q15166 354 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF614Q8N883 585 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MORN4Q8NDC4 146 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR4A4PQ8NGN8 299 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CMKLR1Q99788 373 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GAL3ST1Q99999 423 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ALG8Q9BVK2 526 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MED20Q9H944 212 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TREM1Q9NP99 234 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC23A2Q9UGH3 650 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SNRPGP15A8MWD9 76 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SLC16A5O15375 505 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RLN1P04808 185 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 HEXAP06865 529 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 MPIP34949 423 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ELFN2Q5R3F8 820 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 SKA3Q8IX90 412 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 IL17FQ96PD4 163 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TTTY10Q9BZA0 68 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 RNF122Q9H9V4 155 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 PDE7BQ9NP56 450 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ACKR4Q9NPB9 350 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM138Q9NPI0 162 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 TAC3Q9UHF0 121 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 CXorf65A6NEN9 183 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 OIP5O43482 229 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ATP1B1P05026 303 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
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